Protein–RNA interactions for Protein: Q02556

IRF8, Interferon regulatory factor 8, humanhuman

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF8Q02556 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
IRF8Q02556 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
IRF8Q02556 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
IRF8Q02556 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
IRF8Q02556 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
IRF8Q02556 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
IRF8Q02556 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
IRF8Q02556 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
IRF8Q02556 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
IRF8Q02556 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
IRF8Q02556 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
IRF8Q02556 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
IRF8Q02556 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
IRF8Q02556 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
IRF8Q02556 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
IRF8Q02556 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
IRF8Q02556 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
IRF8Q02556 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
IRF8Q02556 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
IRF8Q02556 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
IRF8Q02556 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
IRF8Q02556 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
IRF8Q02556 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
IRF8Q02556 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
IRF8Q02556 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
IRF8Q02556 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
IRF8Q02556 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
IRF8Q02556 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
IRF8Q02556 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
IRF8Q02556 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
IRF8Q02556 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
IRF8Q02556 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
IRF8Q02556 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
IRF8Q02556 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
IRF8Q02556 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
IRF8Q02556 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
IRF8Q02556 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
IRF8Q02556 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
IRF8Q02556 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
IRF8Q02556 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
IRF8Q02556 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
IRF8Q02556 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
IRF8Q02556 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
IRF8Q02556 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
IRF8Q02556 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
IRF8Q02556 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
IRF8Q02556 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
IRF8Q02556 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
IRF8Q02556 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
IRF8Q02556 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
IRF8Q02556 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
IRF8Q02556 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
IRF8Q02556 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
IRF8Q02556 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
IRF8Q02556 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
IRF8Q02556 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
IRF8Q02556 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
IRF8Q02556 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
IRF8Q02556 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
IRF8Q02556 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
IRF8Q02556 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
IRF8Q02556 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
IRF8Q02556 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
IRF8Q02556 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
IRF8Q02556 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
IRF8Q02556 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
IRF8Q02556 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
IRF8Q02556 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
IRF8Q02556 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
IRF8Q02556 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
IRF8Q02556 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
IRF8Q02556 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
IRF8Q02556 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
IRF8Q02556 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
IRF8Q02556 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
IRF8Q02556 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
IRF8Q02556 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
IRF8Q02556 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
IRF8Q02556 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
IRF8Q02556 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
IRF8Q02556 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
IRF8Q02556 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
IRF8Q02556 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
IRF8Q02556 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
IRF8Q02556 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
IRF8Q02556 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
IRF8Q02556 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
IRF8Q02556 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
IRF8Q02556 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
IRF8Q02556 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
IRF8Q02556 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
IRF8Q02556 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
IRF8Q02556 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
IRF8Q02556 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
IRF8Q02556 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
IRF8Q02556 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
IRF8Q02556 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
IRF8Q02556 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
IRF8Q02556 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
IRF8Q02556 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms