Protein–RNA interactions for Protein: Q01524

DEFA6, Defensin-6, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA6Q01524 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
DEFA6Q01524 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DEFA6Q01524 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DEFA6Q01524 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DEFA6Q01524 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
DEFA6Q01524 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
DEFA6Q01524 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DEFA6Q01524 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DEFA6Q01524 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DEFA6Q01524 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DEFA6Q01524 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DEFA6Q01524 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DEFA6Q01524 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DEFA6Q01524 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DEFA6Q01524 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
DEFA6Q01524 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DEFA6Q01524 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
DEFA6Q01524 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
DEFA6Q01524 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DEFA6Q01524 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
DEFA6Q01524 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DEFA6Q01524 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DEFA6Q01524 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DEFA6Q01524 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DEFA6Q01524 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DEFA6Q01524 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DEFA6Q01524 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
DEFA6Q01524 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
DEFA6Q01524 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DEFA6Q01524 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DEFA6Q01524 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
DEFA6Q01524 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DEFA6Q01524 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DEFA6Q01524 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
DEFA6Q01524 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
DEFA6Q01524 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
DEFA6Q01524 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
DEFA6Q01524 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DEFA6Q01524 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
DEFA6Q01524 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DEFA6Q01524 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
DEFA6Q01524 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
DEFA6Q01524 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DEFA6Q01524 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
DEFA6Q01524 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DEFA6Q01524 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
DEFA6Q01524 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DEFA6Q01524 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DEFA6Q01524 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
DEFA6Q01524 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
DEFA6Q01524 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
DEFA6Q01524 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
DEFA6Q01524 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
DEFA6Q01524 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
DEFA6Q01524 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
DEFA6Q01524 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
DEFA6Q01524 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
DEFA6Q01524 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
DEFA6Q01524 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
DEFA6Q01524 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
DEFA6Q01524 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
DEFA6Q01524 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
DEFA6Q01524 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
DEFA6Q01524 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
DEFA6Q01524 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
DEFA6Q01524 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
DEFA6Q01524 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
DEFA6Q01524 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
DEFA6Q01524 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
DEFA6Q01524 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
DEFA6Q01524 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
DEFA6Q01524 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
DEFA6Q01524 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
DEFA6Q01524 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
DEFA6Q01524 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
DEFA6Q01524 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
DEFA6Q01524 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
DEFA6Q01524 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
DEFA6Q01524 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
DEFA6Q01524 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
DEFA6Q01524 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
DEFA6Q01524 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
DEFA6Q01524 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
DEFA6Q01524 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
DEFA6Q01524 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
DEFA6Q01524 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
DEFA6Q01524 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
DEFA6Q01524 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
DEFA6Q01524 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DEFA6Q01524 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DEFA6Q01524 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DEFA6Q01524 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
DEFA6Q01524 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DEFA6Q01524 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
DEFA6Q01524 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
DEFA6Q01524 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
DEFA6Q01524 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
DEFA6Q01524 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
DEFA6Q01524 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DEFA6Q01524 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms