Protein–RNA interactions for Protein: Q01523

DEFA5, Defensin-5, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA5Q01523 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
DEFA5Q01523 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
DEFA5Q01523 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
DEFA5Q01523 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
DEFA5Q01523 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
DEFA5Q01523 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
DEFA5Q01523 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
DEFA5Q01523 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
DEFA5Q01523 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
DEFA5Q01523 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
DEFA5Q01523 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
DEFA5Q01523 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
DEFA5Q01523 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
DEFA5Q01523 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
DEFA5Q01523 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DEFA5Q01523 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DEFA5Q01523 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DEFA5Q01523 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
DEFA5Q01523 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DEFA5Q01523 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
DEFA5Q01523 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DEFA5Q01523 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DEFA5Q01523 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
DEFA5Q01523 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
DEFA5Q01523 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
DEFA5Q01523 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
DEFA5Q01523 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DEFA5Q01523 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DEFA5Q01523 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DEFA5Q01523 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
DEFA5Q01523 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
DEFA5Q01523 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
DEFA5Q01523 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
DEFA5Q01523 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
DEFA5Q01523 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
DEFA5Q01523 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
DEFA5Q01523 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
DEFA5Q01523 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
DEFA5Q01523 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
DEFA5Q01523 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
DEFA5Q01523 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
DEFA5Q01523 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
DEFA5Q01523 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
DEFA5Q01523 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
DEFA5Q01523 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
DEFA5Q01523 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
DEFA5Q01523 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
DEFA5Q01523 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
DEFA5Q01523 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
DEFA5Q01523 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
DEFA5Q01523 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
DEFA5Q01523 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
DEFA5Q01523 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
DEFA5Q01523 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
DEFA5Q01523 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
DEFA5Q01523 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
DEFA5Q01523 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
DEFA5Q01523 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
DEFA5Q01523 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
DEFA5Q01523 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
DEFA5Q01523 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
DEFA5Q01523 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
DEFA5Q01523 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
DEFA5Q01523 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
DEFA5Q01523 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
DEFA5Q01523 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
DEFA5Q01523 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
DEFA5Q01523 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
DEFA5Q01523 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
DEFA5Q01523 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
DEFA5Q01523 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
DEFA5Q01523 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
DEFA5Q01523 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
DEFA5Q01523 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
DEFA5Q01523 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
DEFA5Q01523 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
DEFA5Q01523 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
DEFA5Q01523 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
DEFA5Q01523 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
DEFA5Q01523 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
DEFA5Q01523 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
DEFA5Q01523 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
DEFA5Q01523 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
DEFA5Q01523 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
DEFA5Q01523 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
DEFA5Q01523 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
DEFA5Q01523 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
DEFA5Q01523 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
DEFA5Q01523 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
DEFA5Q01523 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
DEFA5Q01523 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
DEFA5Q01523 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
DEFA5Q01523 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
DEFA5Q01523 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
DEFA5Q01523 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
DEFA5Q01523 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
DEFA5Q01523 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
DEFA5Q01523 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
DEFA5Q01523 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
DEFA5Q01523 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms