Protein–RNA interactions for Protein: Q00535

CDK5, Cyclin-dependent-like kinase 5, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5Q00535 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CDK5Q00535 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CDK5Q00535 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
CDK5Q00535 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CDK5Q00535 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CDK5Q00535 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CDK5Q00535 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CDK5Q00535 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CDK5Q00535 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CDK5Q00535 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CDK5Q00535 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CDK5Q00535 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CDK5Q00535 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CDK5Q00535 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CDK5Q00535 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CDK5Q00535 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CDK5Q00535 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CDK5Q00535 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CDK5Q00535 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CDK5Q00535 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CDK5Q00535 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CDK5Q00535 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CDK5Q00535 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CDK5Q00535 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CDK5Q00535 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CDK5Q00535 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CDK5Q00535 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CDK5Q00535 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CDK5Q00535 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CDK5Q00535 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CDK5Q00535 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CDK5Q00535 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CDK5Q00535 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CDK5Q00535 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CDK5Q00535 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CDK5Q00535 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CDK5Q00535 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CDK5Q00535 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CDK5Q00535 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CDK5Q00535 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CDK5Q00535 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CDK5Q00535 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CDK5Q00535 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CDK5Q00535 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CDK5Q00535 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CDK5Q00535 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CDK5Q00535 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CDK5Q00535 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
CDK5Q00535 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CDK5Q00535 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CDK5Q00535 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CDK5Q00535 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CDK5Q00535 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CDK5Q00535 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CDK5Q00535 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CDK5Q00535 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CDK5Q00535 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CDK5Q00535 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CDK5Q00535 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CDK5Q00535 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CDK5Q00535 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
CDK5Q00535 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
CDK5Q00535 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CDK5Q00535 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CDK5Q00535 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
CDK5Q00535 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
CDK5Q00535 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CDK5Q00535 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CDK5Q00535 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CDK5Q00535 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CDK5Q00535 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CDK5Q00535 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CDK5Q00535 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
CDK5Q00535 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CDK5Q00535 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CDK5Q00535 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CDK5Q00535 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CDK5Q00535 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CDK5Q00535 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CDK5Q00535 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CDK5Q00535 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CDK5Q00535 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CDK5Q00535 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CDK5Q00535 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CDK5Q00535 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CDK5Q00535 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CDK5Q00535 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CDK5Q00535 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CDK5Q00535 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CDK5Q00535 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CDK5Q00535 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CDK5Q00535 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CDK5Q00535 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CDK5Q00535 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CDK5Q00535 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CDK5Q00535 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CDK5Q00535 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CDK5Q00535 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CDK5Q00535 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CDK5Q00535 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms