Protein–RNA interactions for Protein: P78371

CCT2, T-complex protein 1 subunit beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCT2P78371 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCT2P78371 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCT2P78371 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCT2P78371 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCT2P78371 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CCT2P78371 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCT2P78371 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCT2P78371 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCT2P78371 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCT2P78371 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCT2P78371 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCT2P78371 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCT2P78371 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCT2P78371 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCT2P78371 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCT2P78371 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCT2P78371 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCT2P78371 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCT2P78371 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCT2P78371 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCT2P78371 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCT2P78371 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCT2P78371 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCT2P78371 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCT2P78371 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCT2P78371 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCT2P78371 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCT2P78371 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCT2P78371 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCT2P78371 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCT2P78371 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCT2P78371 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCT2P78371 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCT2P78371 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCT2P78371 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCT2P78371 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCT2P78371 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCT2P78371 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCT2P78371 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCT2P78371 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCT2P78371 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCT2P78371 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCT2P78371 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCT2P78371 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCT2P78371 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCT2P78371 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCT2P78371 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCT2P78371 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCT2P78371 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCT2P78371 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCT2P78371 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCT2P78371 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCT2P78371 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCT2P78371 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCT2P78371 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCT2P78371 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCT2P78371 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCT2P78371 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCT2P78371 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CCT2P78371 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCT2P78371 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCT2P78371 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCT2P78371 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCT2P78371 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCT2P78371 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCT2P78371 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCT2P78371 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCT2P78371 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCT2P78371 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCT2P78371 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCT2P78371 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCT2P78371 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCT2P78371 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCT2P78371 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCT2P78371 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCT2P78371 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCT2P78371 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCT2P78371 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCT2P78371 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCT2P78371 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCT2P78371 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCT2P78371 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCT2P78371 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCT2P78371 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCT2P78371 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCT2P78371 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCT2P78371 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCT2P78371 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CCT2P78371 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CCT2P78371 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CCT2P78371 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCT2P78371 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCT2P78371 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCT2P78371 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCT2P78371 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCT2P78371 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCT2P78371 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCT2P78371 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCT2P78371 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCT2P78371 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms