Protein–RNA interactions for Protein: P78356

PIP4K2B, Phosphatidylinositol 5-phosphate 4-kinase type-2 beta, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIP4K2BP78356 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
PIP4K2BP78356 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC29.49■■■□□ 2.31
PIP4K2BP78356 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
PIP4K2BP78356 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
PIP4K2BP78356 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
PIP4K2BP78356 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
PIP4K2BP78356 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
PIP4K2BP78356 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
PIP4K2BP78356 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
PIP4K2BP78356 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
PIP4K2BP78356 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
PIP4K2BP78356 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC29.48■■■□□ 2.31
PIP4K2BP78356 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
PIP4K2BP78356 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
PIP4K2BP78356 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
PIP4K2BP78356 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
PIP4K2BP78356 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
PIP4K2BP78356 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
PIP4K2BP78356 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
PIP4K2BP78356 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
PIP4K2BP78356 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
PIP4K2BP78356 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
PIP4K2BP78356 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
PIP4K2BP78356 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
PIP4K2BP78356 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
PIP4K2BP78356 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
PIP4K2BP78356 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
PIP4K2BP78356 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
PIP4K2BP78356 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
PIP4K2BP78356 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
PIP4K2BP78356 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
PIP4K2BP78356 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
PIP4K2BP78356 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
PIP4K2BP78356 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
PIP4K2BP78356 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
PIP4K2BP78356 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
PIP4K2BP78356 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
PIP4K2BP78356 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
PIP4K2BP78356 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
PIP4K2BP78356 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
PIP4K2BP78356 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
PIP4K2BP78356 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
PIP4K2BP78356 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC29.46■■■□□ 2.31
PIP4K2BP78356 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
PIP4K2BP78356 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC29.46■■■□□ 2.31
PIP4K2BP78356 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
PIP4K2BP78356 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
PIP4K2BP78356 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
PIP4K2BP78356 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC29.45■■■□□ 2.31
PIP4K2BP78356 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
PIP4K2BP78356 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
PIP4K2BP78356 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
PIP4K2BP78356 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
PIP4K2BP78356 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
PIP4K2BP78356 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
PIP4K2BP78356 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
PIP4K2BP78356 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC29.45■■■□□ 2.31
PIP4K2BP78356 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
PIP4K2BP78356 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.3
PIP4K2BP78356 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
PIP4K2BP78356 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
PIP4K2BP78356 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
PIP4K2BP78356 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
PIP4K2BP78356 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
PIP4K2BP78356 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
PIP4K2BP78356 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
PIP4K2BP78356 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
PIP4K2BP78356 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
PIP4K2BP78356 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
PIP4K2BP78356 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
PIP4K2BP78356 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
PIP4K2BP78356 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
PIP4K2BP78356 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
PIP4K2BP78356 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
PIP4K2BP78356 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
PIP4K2BP78356 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
PIP4K2BP78356 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
PIP4K2BP78356 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
PIP4K2BP78356 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
PIP4K2BP78356 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
PIP4K2BP78356 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
PIP4K2BP78356 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
PIP4K2BP78356 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
PIP4K2BP78356 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
PIP4K2BP78356 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
PIP4K2BP78356 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
PIP4K2BP78356 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
PIP4K2BP78356 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
PIP4K2BP78356 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
PIP4K2BP78356 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
PIP4K2BP78356 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
PIP4K2BP78356 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
PIP4K2BP78356 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
PIP4K2BP78356 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
PIP4K2BP78356 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
PIP4K2BP78356 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
PIP4K2BP78356 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
PIP4K2BP78356 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
PIP4K2BP78356 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
PIP4K2BP78356 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms