Protein–RNA interactions for Protein: P78348

ASIC1, Acid-sensing ion channel 1, humanhuman

Predictions only

Length 528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASIC1P78348 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
ASIC1P78348 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ASIC1P78348 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ASIC1P78348 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ASIC1P78348 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ASIC1P78348 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ASIC1P78348 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ASIC1P78348 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ASIC1P78348 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ASIC1P78348 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ASIC1P78348 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ASIC1P78348 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ASIC1P78348 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ASIC1P78348 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ASIC1P78348 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ASIC1P78348 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.36
ASIC1P78348 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
ASIC1P78348 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ASIC1P78348 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ASIC1P78348 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ASIC1P78348 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ASIC1P78348 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ASIC1P78348 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
ASIC1P78348 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ASIC1P78348 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ASIC1P78348 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ASIC1P78348 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ASIC1P78348 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
ASIC1P78348 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ASIC1P78348 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ASIC1P78348 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ASIC1P78348 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ASIC1P78348 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ASIC1P78348 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ASIC1P78348 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ASIC1P78348 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ASIC1P78348 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ASIC1P78348 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ASIC1P78348 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ASIC1P78348 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ASIC1P78348 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ASIC1P78348 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ASIC1P78348 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ASIC1P78348 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ASIC1P78348 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
ASIC1P78348 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ASIC1P78348 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ASIC1P78348 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ASIC1P78348 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ASIC1P78348 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ASIC1P78348 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ASIC1P78348 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ASIC1P78348 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ASIC1P78348 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ASIC1P78348 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ASIC1P78348 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ASIC1P78348 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
ASIC1P78348 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ASIC1P78348 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ASIC1P78348 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ASIC1P78348 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ASIC1P78348 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ASIC1P78348 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ASIC1P78348 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ASIC1P78348 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ASIC1P78348 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ASIC1P78348 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ASIC1P78348 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ASIC1P78348 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ASIC1P78348 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ASIC1P78348 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ASIC1P78348 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ASIC1P78348 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ASIC1P78348 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ASIC1P78348 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ASIC1P78348 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ASIC1P78348 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ASIC1P78348 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ASIC1P78348 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ASIC1P78348 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ASIC1P78348 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ASIC1P78348 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ASIC1P78348 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ASIC1P78348 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ASIC1P78348 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ASIC1P78348 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ASIC1P78348 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ASIC1P78348 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ASIC1P78348 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ASIC1P78348 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ASIC1P78348 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ASIC1P78348 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ASIC1P78348 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ASIC1P78348 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ASIC1P78348 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ASIC1P78348 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ASIC1P78348 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ASIC1P78348 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ASIC1P78348 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ASIC1P78348 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms