Protein–RNA interactions for Protein: P68036

UBE2L3, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 L3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 154 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2L3P68036 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBE2L3P68036 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBE2L3P68036 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBE2L3P68036 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBE2L3P68036 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBE2L3P68036 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBE2L3P68036 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBE2L3P68036 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBE2L3P68036 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBE2L3P68036 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBE2L3P68036 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBE2L3P68036 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBE2L3P68036 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBE2L3P68036 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBE2L3P68036 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBE2L3P68036 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBE2L3P68036 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBE2L3P68036 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBE2L3P68036 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
UBE2L3P68036 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
UBE2L3P68036 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
UBE2L3P68036 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
UBE2L3P68036 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
UBE2L3P68036 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
UBE2L3P68036 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
UBE2L3P68036 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
UBE2L3P68036 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
UBE2L3P68036 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
UBE2L3P68036 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
UBE2L3P68036 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
UBE2L3P68036 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
UBE2L3P68036 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
UBE2L3P68036 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
UBE2L3P68036 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
UBE2L3P68036 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
UBE2L3P68036 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
UBE2L3P68036 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
UBE2L3P68036 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
UBE2L3P68036 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
UBE2L3P68036 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
UBE2L3P68036 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
UBE2L3P68036 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
UBE2L3P68036 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
UBE2L3P68036 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
UBE2L3P68036 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
UBE2L3P68036 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
UBE2L3P68036 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
UBE2L3P68036 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
UBE2L3P68036 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
UBE2L3P68036 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
UBE2L3P68036 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
UBE2L3P68036 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
UBE2L3P68036 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
UBE2L3P68036 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
UBE2L3P68036 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
UBE2L3P68036 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
UBE2L3P68036 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
UBE2L3P68036 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
UBE2L3P68036 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
UBE2L3P68036 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
UBE2L3P68036 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
UBE2L3P68036 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBE2L3P68036 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBE2L3P68036 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBE2L3P68036 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBE2L3P68036 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBE2L3P68036 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBE2L3P68036 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBE2L3P68036 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBE2L3P68036 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBE2L3P68036 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBE2L3P68036 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBE2L3P68036 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBE2L3P68036 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBE2L3P68036 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBE2L3P68036 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBE2L3P68036 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBE2L3P68036 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBE2L3P68036 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBE2L3P68036 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBE2L3P68036 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBE2L3P68036 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBE2L3P68036 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBE2L3P68036 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBE2L3P68036 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBE2L3P68036 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBE2L3P68036 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBE2L3P68036 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBE2L3P68036 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBE2L3P68036 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBE2L3P68036 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBE2L3P68036 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBE2L3P68036 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBE2L3P68036 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBE2L3P68036 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBE2L3P68036 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
UBE2L3P68036 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBE2L3P68036 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBE2L3P68036 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBE2L3P68036 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms