Protein–RNA interactions for Protein: P61968

LMO4, LIM domain transcription factor LMO4, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO4P61968 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LMO4P61968 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LMO4P61968 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LMO4P61968 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LMO4P61968 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LMO4P61968 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
LMO4P61968 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
LMO4P61968 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
LMO4P61968 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LMO4P61968 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LMO4P61968 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LMO4P61968 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
LMO4P61968 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
LMO4P61968 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
LMO4P61968 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
LMO4P61968 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
LMO4P61968 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
LMO4P61968 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
LMO4P61968 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
LMO4P61968 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
LMO4P61968 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
LMO4P61968 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
LMO4P61968 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LMO4P61968 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
LMO4P61968 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
LMO4P61968 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LMO4P61968 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
LMO4P61968 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LMO4P61968 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
LMO4P61968 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LMO4P61968 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
LMO4P61968 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
LMO4P61968 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LMO4P61968 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
LMO4P61968 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
LMO4P61968 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
LMO4P61968 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
LMO4P61968 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
LMO4P61968 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LMO4P61968 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LMO4P61968 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LMO4P61968 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
LMO4P61968 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
LMO4P61968 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
LMO4P61968 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
LMO4P61968 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LMO4P61968 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
LMO4P61968 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LMO4P61968 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LMO4P61968 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LMO4P61968 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
LMO4P61968 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LMO4P61968 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LMO4P61968 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LMO4P61968 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LMO4P61968 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LMO4P61968 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
LMO4P61968 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
LMO4P61968 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
LMO4P61968 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LMO4P61968 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LMO4P61968 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LMO4P61968 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LMO4P61968 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LMO4P61968 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
LMO4P61968 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LMO4P61968 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LMO4P61968 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LMO4P61968 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LMO4P61968 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LMO4P61968 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LMO4P61968 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LMO4P61968 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
LMO4P61968 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LMO4P61968 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
LMO4P61968 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LMO4P61968 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
LMO4P61968 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
LMO4P61968 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LMO4P61968 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LMO4P61968 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LMO4P61968 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LMO4P61968 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LMO4P61968 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LMO4P61968 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LMO4P61968 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LMO4P61968 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LMO4P61968 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LMO4P61968 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LMO4P61968 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LMO4P61968 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LMO4P61968 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LMO4P61968 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LMO4P61968 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LMO4P61968 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LMO4P61968 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LMO4P61968 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LMO4P61968 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LMO4P61968 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LMO4P61968 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms