Protein–RNA interactions for Protein: P61550

ERVS71-1, Endogenous retrovirus group S71 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVS71-1P61550 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ERVS71-1P61550 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ERVS71-1P61550 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ERVS71-1P61550 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ERVS71-1P61550 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ERVS71-1P61550 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ERVS71-1P61550 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ERVS71-1P61550 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ERVS71-1P61550 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ERVS71-1P61550 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ERVS71-1P61550 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
ERVS71-1P61550 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ERVS71-1P61550 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ERVS71-1P61550 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ERVS71-1P61550 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ERVS71-1P61550 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ERVS71-1P61550 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
ERVS71-1P61550 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ERVS71-1P61550 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ERVS71-1P61550 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ERVS71-1P61550 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ERVS71-1P61550 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ERVS71-1P61550 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ERVS71-1P61550 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ERVS71-1P61550 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ERVS71-1P61550 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ERVS71-1P61550 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ERVS71-1P61550 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
ERVS71-1P61550 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ERVS71-1P61550 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ERVS71-1P61550 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ERVS71-1P61550 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ERVS71-1P61550 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ERVS71-1P61550 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ERVS71-1P61550 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ERVS71-1P61550 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ERVS71-1P61550 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ERVS71-1P61550 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ERVS71-1P61550 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ERVS71-1P61550 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ERVS71-1P61550 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ERVS71-1P61550 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ERVS71-1P61550 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ERVS71-1P61550 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ERVS71-1P61550 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ERVS71-1P61550 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ERVS71-1P61550 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ERVS71-1P61550 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ERVS71-1P61550 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ERVS71-1P61550 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ERVS71-1P61550 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ERVS71-1P61550 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ERVS71-1P61550 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ERVS71-1P61550 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ERVS71-1P61550 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ERVS71-1P61550 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ERVS71-1P61550 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ERVS71-1P61550 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ERVS71-1P61550 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ERVS71-1P61550 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ERVS71-1P61550 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ERVS71-1P61550 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ERVS71-1P61550 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ERVS71-1P61550 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ERVS71-1P61550 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ERVS71-1P61550 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ERVS71-1P61550 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ERVS71-1P61550 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ERVS71-1P61550 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ERVS71-1P61550 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ERVS71-1P61550 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ERVS71-1P61550 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ERVS71-1P61550 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ERVS71-1P61550 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ERVS71-1P61550 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ERVS71-1P61550 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ERVS71-1P61550 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ERVS71-1P61550 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ERVS71-1P61550 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ERVS71-1P61550 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ERVS71-1P61550 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ERVS71-1P61550 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ERVS71-1P61550 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ERVS71-1P61550 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ERVS71-1P61550 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ERVS71-1P61550 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ERVS71-1P61550 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
ERVS71-1P61550 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ERVS71-1P61550 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ERVS71-1P61550 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ERVS71-1P61550 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ERVS71-1P61550 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ERVS71-1P61550 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
ERVS71-1P61550 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVS71-1P61550 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVS71-1P61550 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVS71-1P61550 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVS71-1P61550 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVS71-1P61550 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVS71-1P61550 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms