Protein–RNA interactions for Protein: P60891

PRPS1, Ribose-phosphate pyrophosphokinase 1, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPS1P60891 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PRPS1P60891 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PRPS1P60891 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PRPS1P60891 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
PRPS1P60891 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PRPS1P60891 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PRPS1P60891 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PRPS1P60891 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PRPS1P60891 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PRPS1P60891 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PRPS1P60891 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
PRPS1P60891 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PRPS1P60891 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PRPS1P60891 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PRPS1P60891 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PRPS1P60891 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PRPS1P60891 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PRPS1P60891 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PRPS1P60891 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PRPS1P60891 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PRPS1P60891 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PRPS1P60891 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PRPS1P60891 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PRPS1P60891 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PRPS1P60891 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PRPS1P60891 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PRPS1P60891 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PRPS1P60891 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PRPS1P60891 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PRPS1P60891 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PRPS1P60891 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PRPS1P60891 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PRPS1P60891 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PRPS1P60891 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PRPS1P60891 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PRPS1P60891 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PRPS1P60891 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PRPS1P60891 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PRPS1P60891 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PRPS1P60891 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PRPS1P60891 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PRPS1P60891 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PRPS1P60891 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PRPS1P60891 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PRPS1P60891 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PRPS1P60891 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PRPS1P60891 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PRPS1P60891 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PRPS1P60891 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PRPS1P60891 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PRPS1P60891 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PRPS1P60891 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PRPS1P60891 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PRPS1P60891 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PRPS1P60891 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PRPS1P60891 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PRPS1P60891 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PRPS1P60891 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PRPS1P60891 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PRPS1P60891 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PRPS1P60891 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PRPS1P60891 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PRPS1P60891 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
PRPS1P60891 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PRPS1P60891 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PRPS1P60891 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PRPS1P60891 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PRPS1P60891 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PRPS1P60891 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PRPS1P60891 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PRPS1P60891 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
PRPS1P60891 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PRPS1P60891 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PRPS1P60891 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PRPS1P60891 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PRPS1P60891 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PRPS1P60891 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PRPS1P60891 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PRPS1P60891 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PRPS1P60891 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PRPS1P60891 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PRPS1P60891 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PRPS1P60891 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
PRPS1P60891 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PRPS1P60891 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PRPS1P60891 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PRPS1P60891 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PRPS1P60891 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PRPS1P60891 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PRPS1P60891 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PRPS1P60891 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PRPS1P60891 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
PRPS1P60891 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PRPS1P60891 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PRPS1P60891 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PRPS1P60891 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PRPS1P60891 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PRPS1P60891 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PRPS1P60891 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PRPS1P60891 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms