Protein–RNA interactions for Protein: P60022

DEFB1, Beta-defensin 1, humanhuman

Predictions only

Length 68 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFB1P60022 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DEFB1P60022 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DEFB1P60022 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DEFB1P60022 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DEFB1P60022 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DEFB1P60022 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DEFB1P60022 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DEFB1P60022 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DEFB1P60022 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DEFB1P60022 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DEFB1P60022 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DEFB1P60022 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DEFB1P60022 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DEFB1P60022 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DEFB1P60022 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DEFB1P60022 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
DEFB1P60022 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
DEFB1P60022 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DEFB1P60022 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DEFB1P60022 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DEFB1P60022 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DEFB1P60022 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DEFB1P60022 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DEFB1P60022 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DEFB1P60022 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DEFB1P60022 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DEFB1P60022 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DEFB1P60022 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DEFB1P60022 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DEFB1P60022 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DEFB1P60022 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DEFB1P60022 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DEFB1P60022 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DEFB1P60022 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DEFB1P60022 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DEFB1P60022 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DEFB1P60022 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DEFB1P60022 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
DEFB1P60022 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DEFB1P60022 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DEFB1P60022 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DEFB1P60022 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DEFB1P60022 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DEFB1P60022 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DEFB1P60022 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DEFB1P60022 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DEFB1P60022 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DEFB1P60022 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DEFB1P60022 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DEFB1P60022 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DEFB1P60022 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DEFB1P60022 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DEFB1P60022 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DEFB1P60022 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DEFB1P60022 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DEFB1P60022 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DEFB1P60022 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DEFB1P60022 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DEFB1P60022 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DEFB1P60022 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DEFB1P60022 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
DEFB1P60022 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DEFB1P60022 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DEFB1P60022 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DEFB1P60022 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DEFB1P60022 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DEFB1P60022 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DEFB1P60022 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DEFB1P60022 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DEFB1P60022 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DEFB1P60022 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DEFB1P60022 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DEFB1P60022 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DEFB1P60022 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DEFB1P60022 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DEFB1P60022 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DEFB1P60022 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DEFB1P60022 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DEFB1P60022 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DEFB1P60022 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DEFB1P60022 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DEFB1P60022 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DEFB1P60022 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DEFB1P60022 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DEFB1P60022 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DEFB1P60022 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DEFB1P60022 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
DEFB1P60022 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DEFB1P60022 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
DEFB1P60022 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
DEFB1P60022 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
DEFB1P60022 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
DEFB1P60022 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
DEFB1P60022 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DEFB1P60022 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
DEFB1P60022 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DEFB1P60022 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DEFB1P60022 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
DEFB1P60022 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
DEFB1P60022 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.9 ms