Protein–RNA interactions for Protein: P58872

RHBDL3, Rhomboid-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDL3P58872 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RHBDL3P58872 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RHBDL3P58872 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RHBDL3P58872 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
RHBDL3P58872 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
RHBDL3P58872 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RHBDL3P58872 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
RHBDL3P58872 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RHBDL3P58872 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RHBDL3P58872 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RHBDL3P58872 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RHBDL3P58872 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RHBDL3P58872 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RHBDL3P58872 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RHBDL3P58872 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
RHBDL3P58872 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
RHBDL3P58872 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RHBDL3P58872 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RHBDL3P58872 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RHBDL3P58872 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RHBDL3P58872 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RHBDL3P58872 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RHBDL3P58872 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RHBDL3P58872 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RHBDL3P58872 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RHBDL3P58872 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RHBDL3P58872 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RHBDL3P58872 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RHBDL3P58872 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RHBDL3P58872 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RHBDL3P58872 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RHBDL3P58872 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RHBDL3P58872 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
RHBDL3P58872 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RHBDL3P58872 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RHBDL3P58872 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RHBDL3P58872 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
RHBDL3P58872 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RHBDL3P58872 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
RHBDL3P58872 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RHBDL3P58872 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RHBDL3P58872 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RHBDL3P58872 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RHBDL3P58872 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RHBDL3P58872 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RHBDL3P58872 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RHBDL3P58872 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
RHBDL3P58872 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RHBDL3P58872 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
RHBDL3P58872 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
RHBDL3P58872 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RHBDL3P58872 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RHBDL3P58872 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RHBDL3P58872 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RHBDL3P58872 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RHBDL3P58872 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RHBDL3P58872 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RHBDL3P58872 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RHBDL3P58872 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RHBDL3P58872 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RHBDL3P58872 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RHBDL3P58872 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RHBDL3P58872 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RHBDL3P58872 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RHBDL3P58872 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RHBDL3P58872 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RHBDL3P58872 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RHBDL3P58872 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RHBDL3P58872 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RHBDL3P58872 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
RHBDL3P58872 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
RHBDL3P58872 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RHBDL3P58872 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RHBDL3P58872 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RHBDL3P58872 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RHBDL3P58872 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RHBDL3P58872 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RHBDL3P58872 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
RHBDL3P58872 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RHBDL3P58872 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RHBDL3P58872 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RHBDL3P58872 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RHBDL3P58872 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
RHBDL3P58872 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RHBDL3P58872 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RHBDL3P58872 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RHBDL3P58872 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RHBDL3P58872 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RHBDL3P58872 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RHBDL3P58872 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RHBDL3P58872 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RHBDL3P58872 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RHBDL3P58872 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RHBDL3P58872 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RHBDL3P58872 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
RHBDL3P58872 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RHBDL3P58872 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RHBDL3P58872 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RHBDL3P58872 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
RHBDL3P58872 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms