Protein–RNA interactions for Protein: P57735

RAB25, Ras-related protein Rab-25, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB25P57735 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAB25P57735 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RAB25P57735 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RAB25P57735 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RAB25P57735 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RAB25P57735 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RAB25P57735 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RAB25P57735 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RAB25P57735 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RAB25P57735 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RAB25P57735 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RAB25P57735 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RAB25P57735 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RAB25P57735 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RAB25P57735 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RAB25P57735 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
RAB25P57735 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RAB25P57735 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RAB25P57735 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RAB25P57735 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RAB25P57735 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RAB25P57735 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RAB25P57735 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RAB25P57735 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RAB25P57735 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RAB25P57735 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RAB25P57735 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RAB25P57735 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RAB25P57735 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RAB25P57735 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RAB25P57735 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RAB25P57735 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RAB25P57735 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RAB25P57735 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RAB25P57735 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RAB25P57735 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RAB25P57735 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RAB25P57735 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RAB25P57735 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
RAB25P57735 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
RAB25P57735 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RAB25P57735 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RAB25P57735 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RAB25P57735 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RAB25P57735 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RAB25P57735 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAB25P57735 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAB25P57735 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAB25P57735 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAB25P57735 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAB25P57735 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAB25P57735 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAB25P57735 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAB25P57735 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAB25P57735 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
RAB25P57735 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAB25P57735 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAB25P57735 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAB25P57735 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAB25P57735 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAB25P57735 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAB25P57735 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAB25P57735 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAB25P57735 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAB25P57735 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAB25P57735 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAB25P57735 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAB25P57735 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAB25P57735 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAB25P57735 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAB25P57735 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RAB25P57735 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RAB25P57735 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RAB25P57735 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RAB25P57735 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RAB25P57735 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RAB25P57735 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RAB25P57735 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RAB25P57735 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RAB25P57735 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RAB25P57735 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RAB25P57735 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RAB25P57735 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RAB25P57735 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RAB25P57735 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
RAB25P57735 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RAB25P57735 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RAB25P57735 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RAB25P57735 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RAB25P57735 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RAB25P57735 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RAB25P57735 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RAB25P57735 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RAB25P57735 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RAB25P57735 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RAB25P57735 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RAB25P57735 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RAB25P57735 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RAB25P57735 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RAB25P57735 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms