Protein–RNA interactions for Protein: P57075

UBASH3A, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein A, humanhuman

Predictions only

Length 661 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBASH3AP57075 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
UBASH3AP57075 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
UBASH3AP57075 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
UBASH3AP57075 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
UBASH3AP57075 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
UBASH3AP57075 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
UBASH3AP57075 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
UBASH3AP57075 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
UBASH3AP57075 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
UBASH3AP57075 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
UBASH3AP57075 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
UBASH3AP57075 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
UBASH3AP57075 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
UBASH3AP57075 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
UBASH3AP57075 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
UBASH3AP57075 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
UBASH3AP57075 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
UBASH3AP57075 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
UBASH3AP57075 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
UBASH3AP57075 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
UBASH3AP57075 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
UBASH3AP57075 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
UBASH3AP57075 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
UBASH3AP57075 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
UBASH3AP57075 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
UBASH3AP57075 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
UBASH3AP57075 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
UBASH3AP57075 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
UBASH3AP57075 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
UBASH3AP57075 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
UBASH3AP57075 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
UBASH3AP57075 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
UBASH3AP57075 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
UBASH3AP57075 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
UBASH3AP57075 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
UBASH3AP57075 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
UBASH3AP57075 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
UBASH3AP57075 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
UBASH3AP57075 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
UBASH3AP57075 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
UBASH3AP57075 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
UBASH3AP57075 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
UBASH3AP57075 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
UBASH3AP57075 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
UBASH3AP57075 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
UBASH3AP57075 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
UBASH3AP57075 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
UBASH3AP57075 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
UBASH3AP57075 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
UBASH3AP57075 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
UBASH3AP57075 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
UBASH3AP57075 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
UBASH3AP57075 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
UBASH3AP57075 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
UBASH3AP57075 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
UBASH3AP57075 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
UBASH3AP57075 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
UBASH3AP57075 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
UBASH3AP57075 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
UBASH3AP57075 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
UBASH3AP57075 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
UBASH3AP57075 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.31
UBASH3AP57075 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
UBASH3AP57075 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
UBASH3AP57075 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
UBASH3AP57075 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
UBASH3AP57075 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
UBASH3AP57075 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
UBASH3AP57075 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
UBASH3AP57075 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
UBASH3AP57075 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
UBASH3AP57075 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
UBASH3AP57075 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
UBASH3AP57075 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
UBASH3AP57075 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
UBASH3AP57075 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
UBASH3AP57075 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
UBASH3AP57075 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
UBASH3AP57075 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
UBASH3AP57075 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
UBASH3AP57075 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
UBASH3AP57075 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
UBASH3AP57075 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
UBASH3AP57075 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
UBASH3AP57075 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
UBASH3AP57075 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
UBASH3AP57075 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
UBASH3AP57075 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
UBASH3AP57075 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
UBASH3AP57075 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
UBASH3AP57075 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
UBASH3AP57075 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
UBASH3AP57075 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
UBASH3AP57075 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
UBASH3AP57075 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
UBASH3AP57075 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
UBASH3AP57075 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
UBASH3AP57075 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
UBASH3AP57075 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
UBASH3AP57075 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms