Protein–RNA interactions for Protein: P56915

GSC, Homeobox protein goosecoid, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSCP56915 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GSCP56915 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GSCP56915 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
GSCP56915 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GSCP56915 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GSCP56915 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GSCP56915 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
GSCP56915 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GSCP56915 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GSCP56915 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GSCP56915 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GSCP56915 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GSCP56915 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GSCP56915 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GSCP56915 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GSCP56915 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GSCP56915 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GSCP56915 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GSCP56915 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GSCP56915 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GSCP56915 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GSCP56915 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GSCP56915 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GSCP56915 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GSCP56915 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GSCP56915 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GSCP56915 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GSCP56915 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GSCP56915 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GSCP56915 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GSCP56915 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GSCP56915 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GSCP56915 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GSCP56915 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GSCP56915 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GSCP56915 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GSCP56915 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GSCP56915 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
GSCP56915 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GSCP56915 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GSCP56915 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GSCP56915 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GSCP56915 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GSCP56915 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
GSCP56915 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GSCP56915 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GSCP56915 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GSCP56915 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GSCP56915 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GSCP56915 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GSCP56915 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GSCP56915 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GSCP56915 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GSCP56915 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GSCP56915 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GSCP56915 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GSCP56915 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GSCP56915 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GSCP56915 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GSCP56915 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GSCP56915 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GSCP56915 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GSCP56915 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GSCP56915 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GSCP56915 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GSCP56915 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
GSCP56915 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GSCP56915 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GSCP56915 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GSCP56915 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GSCP56915 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GSCP56915 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GSCP56915 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GSCP56915 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GSCP56915 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GSCP56915 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GSCP56915 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GSCP56915 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GSCP56915 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GSCP56915 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GSCP56915 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GSCP56915 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GSCP56915 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GSCP56915 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GSCP56915 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GSCP56915 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GSCP56915 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GSCP56915 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GSCP56915 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GSCP56915 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GSCP56915 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GSCP56915 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GSCP56915 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GSCP56915 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GSCP56915 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GSCP56915 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GSCP56915 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GSCP56915 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GSCP56915 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GSCP56915 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms