Protein–RNA interactions for Protein: P55327

TPD52, Tumor protein D52, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPD52P55327 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TPD52P55327 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TPD52P55327 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TPD52P55327 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TPD52P55327 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TPD52P55327 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TPD52P55327 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
TPD52P55327 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
TPD52P55327 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TPD52P55327 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
TPD52P55327 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
TPD52P55327 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TPD52P55327 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TPD52P55327 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TPD52P55327 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TPD52P55327 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TPD52P55327 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TPD52P55327 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
TPD52P55327 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TPD52P55327 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TPD52P55327 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TPD52P55327 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TPD52P55327 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TPD52P55327 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TPD52P55327 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TPD52P55327 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TPD52P55327 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TPD52P55327 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
TPD52P55327 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TPD52P55327 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
TPD52P55327 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TPD52P55327 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TPD52P55327 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TPD52P55327 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TPD52P55327 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TPD52P55327 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TPD52P55327 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TPD52P55327 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TPD52P55327 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TPD52P55327 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TPD52P55327 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TPD52P55327 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TPD52P55327 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TPD52P55327 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
TPD52P55327 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TPD52P55327 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TPD52P55327 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TPD52P55327 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TPD52P55327 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TPD52P55327 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
TPD52P55327 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TPD52P55327 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TPD52P55327 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TPD52P55327 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TPD52P55327 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
TPD52P55327 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TPD52P55327 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
TPD52P55327 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
TPD52P55327 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
TPD52P55327 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TPD52P55327 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
TPD52P55327 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TPD52P55327 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TPD52P55327 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TPD52P55327 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TPD52P55327 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TPD52P55327 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TPD52P55327 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TPD52P55327 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TPD52P55327 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TPD52P55327 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TPD52P55327 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TPD52P55327 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TPD52P55327 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TPD52P55327 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TPD52P55327 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
TPD52P55327 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TPD52P55327 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TPD52P55327 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TPD52P55327 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TPD52P55327 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
TPD52P55327 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TPD52P55327 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TPD52P55327 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TPD52P55327 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TPD52P55327 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TPD52P55327 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TPD52P55327 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TPD52P55327 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TPD52P55327 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TPD52P55327 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TPD52P55327 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TPD52P55327 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TPD52P55327 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TPD52P55327 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TPD52P55327 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TPD52P55327 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TPD52P55327 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TPD52P55327 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TPD52P55327 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms