Protein–RNA interactions for Protein: P55011

SLC12A2, Solute carrier family 12 member 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC12A2P55011 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC12A2P55011 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC12A2P55011 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC12A2P55011 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC12A2P55011 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC12A2P55011 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC12A2P55011 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC12A2P55011 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC12A2P55011 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC12A2P55011 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC12A2P55011 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC12A2P55011 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC12A2P55011 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC12A2P55011 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC12A2P55011 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC12A2P55011 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC12A2P55011 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC12A2P55011 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC12A2P55011 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC12A2P55011 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC12A2P55011 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC12A2P55011 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC12A2P55011 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC12A2P55011 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC12A2P55011 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC12A2P55011 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC12A2P55011 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC12A2P55011 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC12A2P55011 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC12A2P55011 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC12A2P55011 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC12A2P55011 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC12A2P55011 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC12A2P55011 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC12A2P55011 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC12A2P55011 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC12A2P55011 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC12A2P55011 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC12A2P55011 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC12A2P55011 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC12A2P55011 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC12A2P55011 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC12A2P55011 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC12A2P55011 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC12A2P55011 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC12A2P55011 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC12A2P55011 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLC12A2P55011 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLC12A2P55011 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLC12A2P55011 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLC12A2P55011 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLC12A2P55011 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLC12A2P55011 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLC12A2P55011 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLC12A2P55011 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLC12A2P55011 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLC12A2P55011 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SLC12A2P55011 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
SLC12A2P55011 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SLC12A2P55011 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SLC12A2P55011 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
SLC12A2P55011 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SLC12A2P55011 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SLC12A2P55011 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC12A2P55011 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC12A2P55011 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC12A2P55011 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC12A2P55011 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC12A2P55011 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC12A2P55011 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC12A2P55011 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC12A2P55011 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC12A2P55011 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC12A2P55011 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLC12A2P55011 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLC12A2P55011 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLC12A2P55011 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLC12A2P55011 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLC12A2P55011 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLC12A2P55011 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLC12A2P55011 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLC12A2P55011 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLC12A2P55011 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLC12A2P55011 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
SLC12A2P55011 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLC12A2P55011 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLC12A2P55011 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLC12A2P55011 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SLC12A2P55011 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SLC12A2P55011 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SLC12A2P55011 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SLC12A2P55011 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SLC12A2P55011 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SLC12A2P55011 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SLC12A2P55011 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SLC12A2P55011 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SLC12A2P55011 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SLC12A2P55011 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SLC12A2P55011 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SLC12A2P55011 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms