Protein–RNA interactions for Protein: P54760

EPHB4, Ephrin type-B receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 987 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHB4P54760 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
EPHB4P54760 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
EPHB4P54760 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
EPHB4P54760 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
EPHB4P54760 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
EPHB4P54760 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
EPHB4P54760 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
EPHB4P54760 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
EPHB4P54760 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
EPHB4P54760 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
EPHB4P54760 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
EPHB4P54760 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
EPHB4P54760 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
EPHB4P54760 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
EPHB4P54760 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
EPHB4P54760 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
EPHB4P54760 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
EPHB4P54760 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
EPHB4P54760 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
EPHB4P54760 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
EPHB4P54760 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
EPHB4P54760 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
EPHB4P54760 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
EPHB4P54760 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
EPHB4P54760 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
EPHB4P54760 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
EPHB4P54760 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
EPHB4P54760 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
EPHB4P54760 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
EPHB4P54760 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
EPHB4P54760 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
EPHB4P54760 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
EPHB4P54760 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
EPHB4P54760 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
EPHB4P54760 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
EPHB4P54760 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
EPHB4P54760 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
EPHB4P54760 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
EPHB4P54760 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
EPHB4P54760 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
EPHB4P54760 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
EPHB4P54760 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
EPHB4P54760 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
EPHB4P54760 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
EPHB4P54760 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
EPHB4P54760 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
EPHB4P54760 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
EPHB4P54760 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
EPHB4P54760 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
EPHB4P54760 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
EPHB4P54760 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
EPHB4P54760 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
EPHB4P54760 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
EPHB4P54760 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
EPHB4P54760 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
EPHB4P54760 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
EPHB4P54760 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
EPHB4P54760 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
EPHB4P54760 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
EPHB4P54760 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
EPHB4P54760 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
EPHB4P54760 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
EPHB4P54760 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
EPHB4P54760 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
EPHB4P54760 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
EPHB4P54760 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
EPHB4P54760 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
EPHB4P54760 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
EPHB4P54760 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
EPHB4P54760 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
EPHB4P54760 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
EPHB4P54760 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
EPHB4P54760 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
EPHB4P54760 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
EPHB4P54760 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
EPHB4P54760 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
EPHB4P54760 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
EPHB4P54760 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
EPHB4P54760 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
EPHB4P54760 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
EPHB4P54760 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
EPHB4P54760 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
EPHB4P54760 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
EPHB4P54760 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
EPHB4P54760 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
EPHB4P54760 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
EPHB4P54760 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
EPHB4P54760 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
EPHB4P54760 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
EPHB4P54760 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
EPHB4P54760 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
EPHB4P54760 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
EPHB4P54760 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
EPHB4P54760 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
EPHB4P54760 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
EPHB4P54760 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
EPHB4P54760 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
EPHB4P54760 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
EPHB4P54760 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
EPHB4P54760 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms