Protein–RNA interactions for Protein: P53671

LIMK2, LIM domain kinase 2, humanhuman

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMK2P53671 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC21.3■■□□□ 1
LIMK2P53671 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC21.3■■□□□ 1
LIMK2P53671 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC21.3■■□□□ 1
LIMK2P53671 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC21.3■■□□□ 1
LIMK2P53671 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC21.3■■□□□ 1
LIMK2P53671 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC21.3■■□□□ 1
LIMK2P53671 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC21.3■■□□□ 1
LIMK2P53671 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
LIMK2P53671 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LIMK2P53671 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LIMK2P53671 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LIMK2P53671 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LIMK2P53671 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LIMK2P53671 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LIMK2P53671 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LIMK2P53671 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
LIMK2P53671 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LIMK2P53671 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LIMK2P53671 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LIMK2P53671 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LIMK2P53671 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LIMK2P53671 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
LIMK2P53671 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
LIMK2P53671 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
LIMK2P53671 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LIMK2P53671 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LIMK2P53671 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
LIMK2P53671 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LIMK2P53671 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LIMK2P53671 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
LIMK2P53671 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LIMK2P53671 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LIMK2P53671 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LIMK2P53671 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
LIMK2P53671 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
LIMK2P53671 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LIMK2P53671 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LIMK2P53671 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LIMK2P53671 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
LIMK2P53671 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
LIMK2P53671 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LIMK2P53671 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LIMK2P53671 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LIMK2P53671 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LIMK2P53671 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
LIMK2P53671 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
LIMK2P53671 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LIMK2P53671 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LIMK2P53671 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC21.27■■□□□ 1
LIMK2P53671 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
LIMK2P53671 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LIMK2P53671 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LIMK2P53671 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LIMK2P53671 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LIMK2P53671 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
LIMK2P53671 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
LIMK2P53671 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
LIMK2P53671 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
LIMK2P53671 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LIMK2P53671 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LIMK2P53671 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LIMK2P53671 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LIMK2P53671 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LIMK2P53671 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LIMK2P53671 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LIMK2P53671 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LIMK2P53671 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LIMK2P53671 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LIMK2P53671 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LIMK2P53671 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LIMK2P53671 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
LIMK2P53671 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LIMK2P53671 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LIMK2P53671 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LIMK2P53671 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LIMK2P53671 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LIMK2P53671 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LIMK2P53671 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LIMK2P53671 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LIMK2P53671 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LIMK2P53671 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LIMK2P53671 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LIMK2P53671 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LIMK2P53671 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LIMK2P53671 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LIMK2P53671 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LIMK2P53671 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LIMK2P53671 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LIMK2P53671 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LIMK2P53671 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LIMK2P53671 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LIMK2P53671 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
LIMK2P53671 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LIMK2P53671 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LIMK2P53671 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LIMK2P53671 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LIMK2P53671 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LIMK2P53671 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LIMK2P53671 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
LIMK2P53671 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms