Protein–RNA interactions for Protein: P53539

FOSB, Protein fosB, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOSBP53539 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FOSBP53539 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FOSBP53539 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FOSBP53539 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
FOSBP53539 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
FOSBP53539 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
FOSBP53539 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
FOSBP53539 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FOSBP53539 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
FOSBP53539 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
FOSBP53539 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
FOSBP53539 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FOSBP53539 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
FOSBP53539 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
FOSBP53539 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
FOSBP53539 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
FOSBP53539 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
FOSBP53539 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FOSBP53539 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
FOSBP53539 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FOSBP53539 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FOSBP53539 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
FOSBP53539 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FOSBP53539 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
FOSBP53539 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
FOSBP53539 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
FOSBP53539 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
FOSBP53539 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
FOSBP53539 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
FOSBP53539 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
FOSBP53539 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
FOSBP53539 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
FOSBP53539 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
FOSBP53539 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
FOSBP53539 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FOSBP53539 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FOSBP53539 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FOSBP53539 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FOSBP53539 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
FOSBP53539 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
FOSBP53539 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FOSBP53539 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
FOSBP53539 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
FOSBP53539 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
FOSBP53539 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FOSBP53539 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FOSBP53539 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
FOSBP53539 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FOSBP53539 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
FOSBP53539 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
FOSBP53539 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
FOSBP53539 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FOSBP53539 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FOSBP53539 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
FOSBP53539 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FOSBP53539 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FOSBP53539 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FOSBP53539 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FOSBP53539 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FOSBP53539 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FOSBP53539 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
FOSBP53539 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
FOSBP53539 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
FOSBP53539 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FOSBP53539 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FOSBP53539 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FOSBP53539 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FOSBP53539 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
FOSBP53539 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
FOSBP53539 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
FOSBP53539 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
FOSBP53539 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FOSBP53539 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FOSBP53539 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
FOSBP53539 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FOSBP53539 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
FOSBP53539 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FOSBP53539 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
FOSBP53539 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
FOSBP53539 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FOSBP53539 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FOSBP53539 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FOSBP53539 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
FOSBP53539 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
FOSBP53539 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
FOSBP53539 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
FOSBP53539 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
FOSBP53539 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
FOSBP53539 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
FOSBP53539 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
FOSBP53539 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
FOSBP53539 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
FOSBP53539 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
FOSBP53539 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
FOSBP53539 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
FOSBP53539 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
FOSBP53539 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
FOSBP53539 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
FOSBP53539 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.52
FOSBP53539 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms