Protein–RNA interactions for Protein: P49356

FNTB, Protein farnesyltransferase subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNTBP49356 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FNTBP49356 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FNTBP49356 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FNTBP49356 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FNTBP49356 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FNTBP49356 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FNTBP49356 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FNTBP49356 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FNTBP49356 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FNTBP49356 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FNTBP49356 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FNTBP49356 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FNTBP49356 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FNTBP49356 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FNTBP49356 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FNTBP49356 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FNTBP49356 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FNTBP49356 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FNTBP49356 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FNTBP49356 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FNTBP49356 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FNTBP49356 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FNTBP49356 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FNTBP49356 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FNTBP49356 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FNTBP49356 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FNTBP49356 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FNTBP49356 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FNTBP49356 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FNTBP49356 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FNTBP49356 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FNTBP49356 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FNTBP49356 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
FNTBP49356 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
FNTBP49356 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
FNTBP49356 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
FNTBP49356 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
FNTBP49356 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
FNTBP49356 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
FNTBP49356 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
FNTBP49356 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FNTBP49356 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FNTBP49356 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
FNTBP49356 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FNTBP49356 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FNTBP49356 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
FNTBP49356 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FNTBP49356 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FNTBP49356 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FNTBP49356 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FNTBP49356 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
FNTBP49356 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
FNTBP49356 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FNTBP49356 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
FNTBP49356 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
FNTBP49356 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FNTBP49356 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
FNTBP49356 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
FNTBP49356 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
FNTBP49356 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
FNTBP49356 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
FNTBP49356 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
FNTBP49356 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
FNTBP49356 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
FNTBP49356 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
FNTBP49356 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
FNTBP49356 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
FNTBP49356 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
FNTBP49356 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
FNTBP49356 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
FNTBP49356 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
FNTBP49356 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
FNTBP49356 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
FNTBP49356 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
FNTBP49356 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
FNTBP49356 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FNTBP49356 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
FNTBP49356 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
FNTBP49356 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FNTBP49356 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FNTBP49356 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
FNTBP49356 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
FNTBP49356 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
FNTBP49356 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
FNTBP49356 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
FNTBP49356 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
FNTBP49356 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
FNTBP49356 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
FNTBP49356 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
FNTBP49356 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FNTBP49356 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FNTBP49356 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FNTBP49356 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
FNTBP49356 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
FNTBP49356 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
FNTBP49356 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
FNTBP49356 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
FNTBP49356 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
FNTBP49356 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
FNTBP49356 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms