Protein–RNA interactions for Protein: P48751

SLC4A3, Anion exchange protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A3P48751 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
SLC4A3P48751 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SLC4A3P48751 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
SLC4A3P48751 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SLC4A3P48751 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SLC4A3P48751 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLC4A3P48751 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
SLC4A3P48751 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLC4A3P48751 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLC4A3P48751 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLC4A3P48751 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLC4A3P48751 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLC4A3P48751 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLC4A3P48751 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLC4A3P48751 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLC4A3P48751 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
SLC4A3P48751 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
SLC4A3P48751 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLC4A3P48751 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLC4A3P48751 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLC4A3P48751 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLC4A3P48751 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLC4A3P48751 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLC4A3P48751 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLC4A3P48751 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLC4A3P48751 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SLC4A3P48751 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SLC4A3P48751 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SLC4A3P48751 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SLC4A3P48751 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SLC4A3P48751 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SLC4A3P48751 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SLC4A3P48751 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SLC4A3P48751 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SLC4A3P48751 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SLC4A3P48751 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
SLC4A3P48751 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
SLC4A3P48751 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SLC4A3P48751 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SLC4A3P48751 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SLC4A3P48751 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SLC4A3P48751 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SLC4A3P48751 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SLC4A3P48751 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SLC4A3P48751 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SLC4A3P48751 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SLC4A3P48751 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SLC4A3P48751 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SLC4A3P48751 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SLC4A3P48751 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SLC4A3P48751 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SLC4A3P48751 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SLC4A3P48751 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SLC4A3P48751 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SLC4A3P48751 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SLC4A3P48751 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SLC4A3P48751 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
SLC4A3P48751 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SLC4A3P48751 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SLC4A3P48751 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SLC4A3P48751 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SLC4A3P48751 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SLC4A3P48751 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SLC4A3P48751 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SLC4A3P48751 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SLC4A3P48751 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SLC4A3P48751 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SLC4A3P48751 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SLC4A3P48751 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SLC4A3P48751 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SLC4A3P48751 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SLC4A3P48751 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SLC4A3P48751 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SLC4A3P48751 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SLC4A3P48751 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SLC4A3P48751 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SLC4A3P48751 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SLC4A3P48751 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SLC4A3P48751 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SLC4A3P48751 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SLC4A3P48751 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SLC4A3P48751 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SLC4A3P48751 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SLC4A3P48751 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SLC4A3P48751 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SLC4A3P48751 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SLC4A3P48751 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SLC4A3P48751 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SLC4A3P48751 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SLC4A3P48751 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
SLC4A3P48751 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SLC4A3P48751 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SLC4A3P48751 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SLC4A3P48751 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SLC4A3P48751 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SLC4A3P48751 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SLC4A3P48751 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SLC4A3P48751 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SLC4A3P48751 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SLC4A3P48751 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms