Protein–RNA interactions for Protein: P42338

PIK3CB, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit beta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,070 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3CBP42338 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PIK3CBP42338 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PIK3CBP42338 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PIK3CBP42338 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PIK3CBP42338 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PIK3CBP42338 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PIK3CBP42338 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PIK3CBP42338 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PIK3CBP42338 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PIK3CBP42338 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PIK3CBP42338 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
PIK3CBP42338 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PIK3CBP42338 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PIK3CBP42338 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PIK3CBP42338 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PIK3CBP42338 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PIK3CBP42338 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PIK3CBP42338 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PIK3CBP42338 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PIK3CBP42338 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PIK3CBP42338 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PIK3CBP42338 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PIK3CBP42338 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
PIK3CBP42338 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PIK3CBP42338 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PIK3CBP42338 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PIK3CBP42338 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PIK3CBP42338 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PIK3CBP42338 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PIK3CBP42338 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PIK3CBP42338 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PIK3CBP42338 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PIK3CBP42338 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PIK3CBP42338 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PIK3CBP42338 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PIK3CBP42338 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PIK3CBP42338 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PIK3CBP42338 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PIK3CBP42338 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PIK3CBP42338 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PIK3CBP42338 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PIK3CBP42338 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PIK3CBP42338 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PIK3CBP42338 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PIK3CBP42338 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PIK3CBP42338 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PIK3CBP42338 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PIK3CBP42338 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PIK3CBP42338 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PIK3CBP42338 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PIK3CBP42338 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PIK3CBP42338 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PIK3CBP42338 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PIK3CBP42338 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PIK3CBP42338 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PIK3CBP42338 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PIK3CBP42338 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
PIK3CBP42338 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
PIK3CBP42338 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.83
PIK3CBP42338 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PIK3CBP42338 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PIK3CBP42338 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PIK3CBP42338 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PIK3CBP42338 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PIK3CBP42338 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PIK3CBP42338 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
PIK3CBP42338 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PIK3CBP42338 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
PIK3CBP42338 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PIK3CBP42338 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PIK3CBP42338 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PIK3CBP42338 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PIK3CBP42338 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PIK3CBP42338 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PIK3CBP42338 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PIK3CBP42338 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PIK3CBP42338 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PIK3CBP42338 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PIK3CBP42338 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PIK3CBP42338 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PIK3CBP42338 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PIK3CBP42338 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PIK3CBP42338 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PIK3CBP42338 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PIK3CBP42338 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PIK3CBP42338 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PIK3CBP42338 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PIK3CBP42338 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PIK3CBP42338 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PIK3CBP42338 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PIK3CBP42338 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PIK3CBP42338 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PIK3CBP42338 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PIK3CBP42338 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PIK3CBP42338 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PIK3CBP42338 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PIK3CBP42338 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PIK3CBP42338 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PIK3CBP42338 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PIK3CBP42338 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms