Protein–RNA interactions for Protein: P42126

ECI1, Enoyl-CoA delta isomerase 1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 302 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECI1P42126 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ECI1P42126 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ECI1P42126 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ECI1P42126 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ECI1P42126 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ECI1P42126 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ECI1P42126 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ECI1P42126 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ECI1P42126 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ECI1P42126 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ECI1P42126 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
ECI1P42126 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ECI1P42126 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ECI1P42126 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ECI1P42126 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ECI1P42126 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ECI1P42126 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ECI1P42126 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ECI1P42126 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ECI1P42126 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ECI1P42126 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
ECI1P42126 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
ECI1P42126 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ECI1P42126 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ECI1P42126 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ECI1P42126 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ECI1P42126 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ECI1P42126 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ECI1P42126 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ECI1P42126 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ECI1P42126 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ECI1P42126 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ECI1P42126 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ECI1P42126 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ECI1P42126 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ECI1P42126 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ECI1P42126 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ECI1P42126 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ECI1P42126 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ECI1P42126 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ECI1P42126 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ECI1P42126 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ECI1P42126 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ECI1P42126 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ECI1P42126 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ECI1P42126 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ECI1P42126 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ECI1P42126 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ECI1P42126 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
ECI1P42126 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ECI1P42126 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ECI1P42126 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ECI1P42126 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ECI1P42126 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ECI1P42126 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ECI1P42126 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ECI1P42126 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ECI1P42126 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
ECI1P42126 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
ECI1P42126 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
ECI1P42126 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
ECI1P42126 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ECI1P42126 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ECI1P42126 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ECI1P42126 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ECI1P42126 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ECI1P42126 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ECI1P42126 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ECI1P42126 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ECI1P42126 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ECI1P42126 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ECI1P42126 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ECI1P42126 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ECI1P42126 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ECI1P42126 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ECI1P42126 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
ECI1P42126 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ECI1P42126 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ECI1P42126 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ECI1P42126 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
ECI1P42126 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ECI1P42126 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ECI1P42126 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ECI1P42126 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ECI1P42126 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ECI1P42126 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ECI1P42126 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
ECI1P42126 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ECI1P42126 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ECI1P42126 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ECI1P42126 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ECI1P42126 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ECI1P42126 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ECI1P42126 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
ECI1P42126 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
ECI1P42126 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ECI1P42126 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ECI1P42126 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ECI1P42126 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ECI1P42126 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms