Protein–RNA interactions for Protein: P36222

CHI3L1, Chitinase-3-like protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHI3L1P36222 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CHI3L1P36222 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CHI3L1P36222 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CHI3L1P36222 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CHI3L1P36222 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CHI3L1P36222 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CHI3L1P36222 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CHI3L1P36222 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CHI3L1P36222 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CHI3L1P36222 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CHI3L1P36222 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CHI3L1P36222 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CHI3L1P36222 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CHI3L1P36222 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CHI3L1P36222 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CHI3L1P36222 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CHI3L1P36222 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CHI3L1P36222 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
CHI3L1P36222 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
CHI3L1P36222 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CHI3L1P36222 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CHI3L1P36222 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CHI3L1P36222 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CHI3L1P36222 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CHI3L1P36222 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CHI3L1P36222 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CHI3L1P36222 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CHI3L1P36222 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CHI3L1P36222 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CHI3L1P36222 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CHI3L1P36222 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CHI3L1P36222 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CHI3L1P36222 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CHI3L1P36222 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CHI3L1P36222 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CHI3L1P36222 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CHI3L1P36222 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CHI3L1P36222 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
CHI3L1P36222 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CHI3L1P36222 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CHI3L1P36222 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CHI3L1P36222 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CHI3L1P36222 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CHI3L1P36222 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CHI3L1P36222 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CHI3L1P36222 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CHI3L1P36222 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CHI3L1P36222 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CHI3L1P36222 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CHI3L1P36222 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
CHI3L1P36222 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CHI3L1P36222 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CHI3L1P36222 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CHI3L1P36222 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CHI3L1P36222 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CHI3L1P36222 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CHI3L1P36222 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CHI3L1P36222 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CHI3L1P36222 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CHI3L1P36222 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CHI3L1P36222 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CHI3L1P36222 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CHI3L1P36222 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
CHI3L1P36222 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CHI3L1P36222 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CHI3L1P36222 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CHI3L1P36222 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CHI3L1P36222 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CHI3L1P36222 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CHI3L1P36222 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CHI3L1P36222 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CHI3L1P36222 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CHI3L1P36222 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CHI3L1P36222 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CHI3L1P36222 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CHI3L1P36222 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CHI3L1P36222 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CHI3L1P36222 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CHI3L1P36222 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CHI3L1P36222 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CHI3L1P36222 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CHI3L1P36222 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CHI3L1P36222 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CHI3L1P36222 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CHI3L1P36222 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CHI3L1P36222 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CHI3L1P36222 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CHI3L1P36222 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CHI3L1P36222 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CHI3L1P36222 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CHI3L1P36222 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CHI3L1P36222 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
CHI3L1P36222 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CHI3L1P36222 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CHI3L1P36222 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CHI3L1P36222 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CHI3L1P36222 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CHI3L1P36222 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CHI3L1P36222 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CHI3L1P36222 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms