Protein–RNA interactions for Protein: P35606

COPB2, Coatomer subunit beta', humanhuman

Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPB2P35606 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
COPB2P35606 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
COPB2P35606 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
COPB2P35606 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
COPB2P35606 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
COPB2P35606 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
COPB2P35606 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
COPB2P35606 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
COPB2P35606 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
COPB2P35606 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
COPB2P35606 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
COPB2P35606 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
COPB2P35606 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
COPB2P35606 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
COPB2P35606 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
COPB2P35606 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
COPB2P35606 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
COPB2P35606 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
COPB2P35606 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
COPB2P35606 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
COPB2P35606 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
COPB2P35606 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
COPB2P35606 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
COPB2P35606 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
COPB2P35606 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
COPB2P35606 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
COPB2P35606 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
COPB2P35606 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
COPB2P35606 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
COPB2P35606 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
COPB2P35606 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
COPB2P35606 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
COPB2P35606 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
COPB2P35606 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
COPB2P35606 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
COPB2P35606 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
COPB2P35606 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
COPB2P35606 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
COPB2P35606 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
COPB2P35606 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
COPB2P35606 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
COPB2P35606 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
COPB2P35606 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
COPB2P35606 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
COPB2P35606 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
COPB2P35606 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
COPB2P35606 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
COPB2P35606 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
COPB2P35606 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
COPB2P35606 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
COPB2P35606 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
COPB2P35606 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
COPB2P35606 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
COPB2P35606 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
COPB2P35606 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
COPB2P35606 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
COPB2P35606 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
COPB2P35606 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
COPB2P35606 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
COPB2P35606 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
COPB2P35606 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
COPB2P35606 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
COPB2P35606 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
COPB2P35606 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
COPB2P35606 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
COPB2P35606 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
COPB2P35606 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
COPB2P35606 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
COPB2P35606 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
COPB2P35606 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
COPB2P35606 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
COPB2P35606 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
COPB2P35606 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
COPB2P35606 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
COPB2P35606 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
COPB2P35606 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
COPB2P35606 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
COPB2P35606 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
COPB2P35606 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
COPB2P35606 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
COPB2P35606 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
COPB2P35606 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
COPB2P35606 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
COPB2P35606 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
COPB2P35606 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
COPB2P35606 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
COPB2P35606 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
COPB2P35606 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
COPB2P35606 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
COPB2P35606 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
COPB2P35606 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
COPB2P35606 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
COPB2P35606 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
COPB2P35606 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
COPB2P35606 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
COPB2P35606 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
COPB2P35606 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
COPB2P35606 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
COPB2P35606 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
COPB2P35606 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms