Protein–RNA interactions for Protein: P35236

PTPN7, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 7, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN7P35236 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTPN7P35236 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
PTPN7P35236 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTPN7P35236 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTPN7P35236 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
PTPN7P35236 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTPN7P35236 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTPN7P35236 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTPN7P35236 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
PTPN7P35236 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
PTPN7P35236 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTPN7P35236 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTPN7P35236 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTPN7P35236 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTPN7P35236 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTPN7P35236 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTPN7P35236 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTPN7P35236 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTPN7P35236 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTPN7P35236 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
PTPN7P35236 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTPN7P35236 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTPN7P35236 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTPN7P35236 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTPN7P35236 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTPN7P35236 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTPN7P35236 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
PTPN7P35236 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTPN7P35236 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTPN7P35236 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTPN7P35236 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTPN7P35236 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTPN7P35236 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTPN7P35236 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTPN7P35236 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTPN7P35236 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTPN7P35236 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTPN7P35236 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTPN7P35236 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTPN7P35236 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTPN7P35236 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTPN7P35236 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTPN7P35236 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTPN7P35236 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
PTPN7P35236 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTPN7P35236 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTPN7P35236 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTPN7P35236 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTPN7P35236 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTPN7P35236 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTPN7P35236 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTPN7P35236 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTPN7P35236 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTPN7P35236 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTPN7P35236 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
PTPN7P35236 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTPN7P35236 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTPN7P35236 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTPN7P35236 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTPN7P35236 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTPN7P35236 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTPN7P35236 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTPN7P35236 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTPN7P35236 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTPN7P35236 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTPN7P35236 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
PTPN7P35236 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTPN7P35236 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PTPN7P35236 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PTPN7P35236 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PTPN7P35236 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PTPN7P35236 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PTPN7P35236 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PTPN7P35236 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PTPN7P35236 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PTPN7P35236 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
PTPN7P35236 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PTPN7P35236 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PTPN7P35236 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PTPN7P35236 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
PTPN7P35236 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PTPN7P35236 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
PTPN7P35236 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PTPN7P35236 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PTPN7P35236 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PTPN7P35236 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
PTPN7P35236 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PTPN7P35236 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PTPN7P35236 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
PTPN7P35236 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPN7P35236 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPN7P35236 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPN7P35236 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPN7P35236 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPN7P35236 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPN7P35236 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPN7P35236 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPN7P35236 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPN7P35236 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPN7P35236 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms