Protein–RNA interactions for Protein: P29965

CD40LG, CD40 ligand, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD40LGP29965 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CD40LGP29965 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CD40LGP29965 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CD40LGP29965 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CD40LGP29965 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CD40LGP29965 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CD40LGP29965 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CD40LGP29965 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CD40LGP29965 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CD40LGP29965 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CD40LGP29965 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CD40LGP29965 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CD40LGP29965 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
CD40LGP29965 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CD40LGP29965 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CD40LGP29965 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CD40LGP29965 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CD40LGP29965 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CD40LGP29965 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CD40LGP29965 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CD40LGP29965 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CD40LGP29965 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CD40LGP29965 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CD40LGP29965 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CD40LGP29965 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CD40LGP29965 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CD40LGP29965 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CD40LGP29965 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CD40LGP29965 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CD40LGP29965 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CD40LGP29965 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CD40LGP29965 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
CD40LGP29965 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CD40LGP29965 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CD40LGP29965 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CD40LGP29965 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CD40LGP29965 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CD40LGP29965 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CD40LGP29965 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CD40LGP29965 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CD40LGP29965 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CD40LGP29965 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CD40LGP29965 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CD40LGP29965 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CD40LGP29965 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CD40LGP29965 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CD40LGP29965 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CD40LGP29965 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CD40LGP29965 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CD40LGP29965 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CD40LGP29965 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CD40LGP29965 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CD40LGP29965 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CD40LGP29965 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CD40LGP29965 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CD40LGP29965 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CD40LGP29965 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CD40LGP29965 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CD40LGP29965 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CD40LGP29965 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CD40LGP29965 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CD40LGP29965 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CD40LGP29965 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CD40LGP29965 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CD40LGP29965 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CD40LGP29965 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CD40LGP29965 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CD40LGP29965 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
CD40LGP29965 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CD40LGP29965 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CD40LGP29965 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CD40LGP29965 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CD40LGP29965 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CD40LGP29965 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CD40LGP29965 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CD40LGP29965 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CD40LGP29965 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CD40LGP29965 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CD40LGP29965 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CD40LGP29965 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CD40LGP29965 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CD40LGP29965 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CD40LGP29965 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CD40LGP29965 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CD40LGP29965 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CD40LGP29965 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CD40LGP29965 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CD40LGP29965 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CD40LGP29965 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CD40LGP29965 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CD40LGP29965 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CD40LGP29965 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
CD40LGP29965 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
CD40LGP29965 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CD40LGP29965 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CD40LGP29965 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CD40LGP29965 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CD40LGP29965 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CD40LGP29965 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
CD40LGP29965 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms