Protein–RNA interactions for Protein: P29084

GTF2E2, Transcription initiation factor IIE subunit beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E2P29084 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GTF2E2P29084 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GTF2E2P29084 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
GTF2E2P29084 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GTF2E2P29084 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GTF2E2P29084 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
GTF2E2P29084 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
GTF2E2P29084 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GTF2E2P29084 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
GTF2E2P29084 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GTF2E2P29084 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GTF2E2P29084 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
GTF2E2P29084 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GTF2E2P29084 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GTF2E2P29084 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GTF2E2P29084 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GTF2E2P29084 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GTF2E2P29084 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GTF2E2P29084 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GTF2E2P29084 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GTF2E2P29084 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GTF2E2P29084 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GTF2E2P29084 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GTF2E2P29084 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GTF2E2P29084 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GTF2E2P29084 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GTF2E2P29084 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
GTF2E2P29084 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GTF2E2P29084 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GTF2E2P29084 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GTF2E2P29084 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GTF2E2P29084 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
GTF2E2P29084 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GTF2E2P29084 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GTF2E2P29084 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GTF2E2P29084 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GTF2E2P29084 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GTF2E2P29084 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GTF2E2P29084 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GTF2E2P29084 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GTF2E2P29084 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GTF2E2P29084 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GTF2E2P29084 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GTF2E2P29084 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GTF2E2P29084 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
GTF2E2P29084 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GTF2E2P29084 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
GTF2E2P29084 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GTF2E2P29084 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GTF2E2P29084 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GTF2E2P29084 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GTF2E2P29084 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GTF2E2P29084 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GTF2E2P29084 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
GTF2E2P29084 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
GTF2E2P29084 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GTF2E2P29084 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
GTF2E2P29084 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GTF2E2P29084 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GTF2E2P29084 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GTF2E2P29084 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GTF2E2P29084 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GTF2E2P29084 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GTF2E2P29084 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GTF2E2P29084 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GTF2E2P29084 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
GTF2E2P29084 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GTF2E2P29084 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GTF2E2P29084 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GTF2E2P29084 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GTF2E2P29084 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GTF2E2P29084 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GTF2E2P29084 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GTF2E2P29084 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GTF2E2P29084 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GTF2E2P29084 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GTF2E2P29084 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GTF2E2P29084 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GTF2E2P29084 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GTF2E2P29084 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GTF2E2P29084 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GTF2E2P29084 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GTF2E2P29084 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
GTF2E2P29084 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GTF2E2P29084 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GTF2E2P29084 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GTF2E2P29084 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GTF2E2P29084 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GTF2E2P29084 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GTF2E2P29084 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GTF2E2P29084 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GTF2E2P29084 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GTF2E2P29084 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GTF2E2P29084 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GTF2E2P29084 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
GTF2E2P29084 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GTF2E2P29084 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GTF2E2P29084 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GTF2E2P29084 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GTF2E2P29084 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms