Protein–RNA interactions for Protein: P27448

MARK3, MAP/microtubule affinity-regulating kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 753 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARK3P27448 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MARK3P27448 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MARK3P27448 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MARK3P27448 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MARK3P27448 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MARK3P27448 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MARK3P27448 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MARK3P27448 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MARK3P27448 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MARK3P27448 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MARK3P27448 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MARK3P27448 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MARK3P27448 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MARK3P27448 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MARK3P27448 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MARK3P27448 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MARK3P27448 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MARK3P27448 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MARK3P27448 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MARK3P27448 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MARK3P27448 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MARK3P27448 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MARK3P27448 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
MARK3P27448 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MARK3P27448 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MARK3P27448 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MARK3P27448 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MARK3P27448 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MARK3P27448 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MARK3P27448 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MARK3P27448 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MARK3P27448 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
MARK3P27448 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MARK3P27448 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MARK3P27448 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MARK3P27448 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MARK3P27448 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MARK3P27448 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MARK3P27448 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MARK3P27448 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MARK3P27448 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MARK3P27448 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MARK3P27448 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MARK3P27448 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MARK3P27448 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MARK3P27448 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
MARK3P27448 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MARK3P27448 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MARK3P27448 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MARK3P27448 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MARK3P27448 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MARK3P27448 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MARK3P27448 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MARK3P27448 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
MARK3P27448 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MARK3P27448 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
MARK3P27448 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MARK3P27448 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MARK3P27448 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
MARK3P27448 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MARK3P27448 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MARK3P27448 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
MARK3P27448 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
MARK3P27448 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MARK3P27448 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
MARK3P27448 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
MARK3P27448 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
MARK3P27448 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MARK3P27448 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
MARK3P27448 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MARK3P27448 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MARK3P27448 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MARK3P27448 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MARK3P27448 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MARK3P27448 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
MARK3P27448 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MARK3P27448 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MARK3P27448 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MARK3P27448 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MARK3P27448 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MARK3P27448 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MARK3P27448 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MARK3P27448 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MARK3P27448 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MARK3P27448 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MARK3P27448 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MARK3P27448 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MARK3P27448 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MARK3P27448 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MARK3P27448 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MARK3P27448 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MARK3P27448 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MARK3P27448 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MARK3P27448 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MARK3P27448 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MARK3P27448 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MARK3P27448 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MARK3P27448 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MARK3P27448 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MARK3P27448 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms