Protein–RNA interactions for Protein: P25800

LMO1, Rhombotin-1, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO1P25800 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LMO1P25800 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LMO1P25800 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LMO1P25800 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LMO1P25800 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LMO1P25800 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LMO1P25800 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LMO1P25800 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LMO1P25800 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LMO1P25800 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LMO1P25800 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LMO1P25800 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LMO1P25800 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LMO1P25800 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
LMO1P25800 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.43
LMO1P25800 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
LMO1P25800 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
LMO1P25800 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
LMO1P25800 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
LMO1P25800 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
LMO1P25800 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
LMO1P25800 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LMO1P25800 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LMO1P25800 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LMO1P25800 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LMO1P25800 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LMO1P25800 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LMO1P25800 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
LMO1P25800 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LMO1P25800 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LMO1P25800 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LMO1P25800 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LMO1P25800 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
LMO1P25800 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LMO1P25800 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LMO1P25800 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LMO1P25800 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LMO1P25800 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LMO1P25800 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LMO1P25800 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LMO1P25800 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LMO1P25800 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LMO1P25800 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LMO1P25800 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LMO1P25800 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LMO1P25800 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LMO1P25800 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LMO1P25800 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LMO1P25800 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LMO1P25800 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LMO1P25800 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LMO1P25800 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LMO1P25800 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LMO1P25800 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
LMO1P25800 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
LMO1P25800 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LMO1P25800 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LMO1P25800 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LMO1P25800 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LMO1P25800 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LMO1P25800 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LMO1P25800 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LMO1P25800 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LMO1P25800 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LMO1P25800 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LMO1P25800 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LMO1P25800 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LMO1P25800 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LMO1P25800 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LMO1P25800 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LMO1P25800 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LMO1P25800 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LMO1P25800 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LMO1P25800 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LMO1P25800 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LMO1P25800 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LMO1P25800 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LMO1P25800 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LMO1P25800 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LMO1P25800 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LMO1P25800 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LMO1P25800 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LMO1P25800 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LMO1P25800 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LMO1P25800 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LMO1P25800 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LMO1P25800 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LMO1P25800 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LMO1P25800 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LMO1P25800 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LMO1P25800 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LMO1P25800 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
LMO1P25800 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LMO1P25800 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LMO1P25800 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LMO1P25800 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LMO1P25800 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LMO1P25800 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LMO1P25800 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LMO1P25800 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms