Protein–RNA interactions for Protein: P23921

RRM1, Ribonucleoside-diphosphate reductase large subunit, humanhuman

Predictions only

Length 792 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRM1P23921 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RRM1P23921 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RRM1P23921 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RRM1P23921 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RRM1P23921 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RRM1P23921 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RRM1P23921 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RRM1P23921 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RRM1P23921 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RRM1P23921 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RRM1P23921 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RRM1P23921 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RRM1P23921 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RRM1P23921 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RRM1P23921 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RRM1P23921 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RRM1P23921 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RRM1P23921 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RRM1P23921 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RRM1P23921 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RRM1P23921 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RRM1P23921 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RRM1P23921 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RRM1P23921 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RRM1P23921 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RRM1P23921 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RRM1P23921 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RRM1P23921 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RRM1P23921 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RRM1P23921 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RRM1P23921 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RRM1P23921 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RRM1P23921 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RRM1P23921 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RRM1P23921 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RRM1P23921 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RRM1P23921 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RRM1P23921 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RRM1P23921 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RRM1P23921 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RRM1P23921 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RRM1P23921 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RRM1P23921 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RRM1P23921 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RRM1P23921 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RRM1P23921 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RRM1P23921 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RRM1P23921 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RRM1P23921 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RRM1P23921 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RRM1P23921 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RRM1P23921 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RRM1P23921 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
RRM1P23921 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RRM1P23921 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
RRM1P23921 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
RRM1P23921 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RRM1P23921 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RRM1P23921 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RRM1P23921 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RRM1P23921 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RRM1P23921 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RRM1P23921 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RRM1P23921 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RRM1P23921 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RRM1P23921 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RRM1P23921 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RRM1P23921 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RRM1P23921 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RRM1P23921 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RRM1P23921 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RRM1P23921 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RRM1P23921 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RRM1P23921 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RRM1P23921 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RRM1P23921 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RRM1P23921 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RRM1P23921 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
RRM1P23921 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RRM1P23921 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RRM1P23921 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RRM1P23921 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RRM1P23921 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RRM1P23921 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RRM1P23921 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RRM1P23921 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RRM1P23921 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RRM1P23921 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RRM1P23921 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RRM1P23921 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RRM1P23921 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RRM1P23921 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RRM1P23921 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
RRM1P23921 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RRM1P23921 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RRM1P23921 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RRM1P23921 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RRM1P23921 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RRM1P23921 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RRM1P23921 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms