Protein–RNA interactions for Protein: P22676

CALB2, Calretinin, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALB2P22676 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CALB2P22676 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CALB2P22676 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CALB2P22676 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CALB2P22676 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CALB2P22676 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CALB2P22676 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CALB2P22676 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CALB2P22676 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CALB2P22676 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CALB2P22676 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CALB2P22676 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CALB2P22676 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CALB2P22676 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CALB2P22676 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CALB2P22676 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CALB2P22676 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CALB2P22676 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CALB2P22676 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CALB2P22676 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CALB2P22676 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CALB2P22676 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CALB2P22676 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CALB2P22676 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CALB2P22676 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CALB2P22676 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CALB2P22676 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CALB2P22676 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CALB2P22676 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
CALB2P22676 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CALB2P22676 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CALB2P22676 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CALB2P22676 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CALB2P22676 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CALB2P22676 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CALB2P22676 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CALB2P22676 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CALB2P22676 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CALB2P22676 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CALB2P22676 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CALB2P22676 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CALB2P22676 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CALB2P22676 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CALB2P22676 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CALB2P22676 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CALB2P22676 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CALB2P22676 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CALB2P22676 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CALB2P22676 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
CALB2P22676 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
CALB2P22676 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
CALB2P22676 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
CALB2P22676 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
CALB2P22676 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CALB2P22676 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CALB2P22676 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CALB2P22676 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CALB2P22676 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CALB2P22676 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CALB2P22676 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CALB2P22676 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CALB2P22676 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CALB2P22676 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CALB2P22676 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CALB2P22676 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CALB2P22676 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CALB2P22676 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CALB2P22676 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CALB2P22676 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CALB2P22676 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CALB2P22676 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CALB2P22676 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CALB2P22676 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CALB2P22676 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CALB2P22676 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CALB2P22676 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CALB2P22676 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CALB2P22676 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CALB2P22676 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CALB2P22676 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CALB2P22676 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CALB2P22676 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CALB2P22676 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CALB2P22676 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CALB2P22676 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CALB2P22676 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CALB2P22676 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CALB2P22676 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CALB2P22676 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CALB2P22676 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CALB2P22676 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CALB2P22676 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CALB2P22676 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CALB2P22676 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CALB2P22676 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CALB2P22676 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CALB2P22676 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CALB2P22676 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CALB2P22676 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CALB2P22676 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms