Protein–RNA interactions for Protein: P22455

FGFR4, Fibroblast growth factor receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 802 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGFR4P22455 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
FGFR4P22455 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
FGFR4P22455 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FGFR4P22455 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FGFR4P22455 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FGFR4P22455 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FGFR4P22455 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FGFR4P22455 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FGFR4P22455 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FGFR4P22455 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FGFR4P22455 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FGFR4P22455 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FGFR4P22455 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
FGFR4P22455 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FGFR4P22455 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FGFR4P22455 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FGFR4P22455 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FGFR4P22455 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
FGFR4P22455 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FGFR4P22455 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FGFR4P22455 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FGFR4P22455 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FGFR4P22455 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FGFR4P22455 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FGFR4P22455 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FGFR4P22455 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FGFR4P22455 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FGFR4P22455 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FGFR4P22455 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FGFR4P22455 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FGFR4P22455 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FGFR4P22455 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FGFR4P22455 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FGFR4P22455 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FGFR4P22455 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FGFR4P22455 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FGFR4P22455 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FGFR4P22455 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FGFR4P22455 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
FGFR4P22455 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FGFR4P22455 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FGFR4P22455 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FGFR4P22455 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FGFR4P22455 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FGFR4P22455 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
FGFR4P22455 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
FGFR4P22455 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FGFR4P22455 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FGFR4P22455 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FGFR4P22455 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FGFR4P22455 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FGFR4P22455 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
FGFR4P22455 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FGFR4P22455 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FGFR4P22455 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FGFR4P22455 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FGFR4P22455 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FGFR4P22455 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FGFR4P22455 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FGFR4P22455 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FGFR4P22455 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FGFR4P22455 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FGFR4P22455 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FGFR4P22455 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
FGFR4P22455 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FGFR4P22455 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FGFR4P22455 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FGFR4P22455 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FGFR4P22455 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FGFR4P22455 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FGFR4P22455 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
FGFR4P22455 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FGFR4P22455 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FGFR4P22455 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FGFR4P22455 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FGFR4P22455 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FGFR4P22455 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FGFR4P22455 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FGFR4P22455 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FGFR4P22455 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FGFR4P22455 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
FGFR4P22455 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FGFR4P22455 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FGFR4P22455 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FGFR4P22455 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
FGFR4P22455 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FGFR4P22455 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
FGFR4P22455 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FGFR4P22455 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FGFR4P22455 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FGFR4P22455 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FGFR4P22455 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FGFR4P22455 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
FGFR4P22455 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FGFR4P22455 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FGFR4P22455 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FGFR4P22455 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FGFR4P22455 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FGFR4P22455 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
FGFR4P22455 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms