Protein–RNA interactions for Protein: P20393

NR1D1, Nuclear receptor subfamily 1 group D member 1, humanhuman

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1D1P20393 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NR1D1P20393 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NR1D1P20393 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NR1D1P20393 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NR1D1P20393 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NR1D1P20393 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NR1D1P20393 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NR1D1P20393 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NR1D1P20393 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NR1D1P20393 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NR1D1P20393 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NR1D1P20393 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NR1D1P20393 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NR1D1P20393 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NR1D1P20393 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NR1D1P20393 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NR1D1P20393 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NR1D1P20393 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NR1D1P20393 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NR1D1P20393 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
NR1D1P20393 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NR1D1P20393 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NR1D1P20393 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NR1D1P20393 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NR1D1P20393 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NR1D1P20393 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NR1D1P20393 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NR1D1P20393 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NR1D1P20393 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NR1D1P20393 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NR1D1P20393 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NR1D1P20393 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
NR1D1P20393 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NR1D1P20393 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NR1D1P20393 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NR1D1P20393 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NR1D1P20393 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NR1D1P20393 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NR1D1P20393 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NR1D1P20393 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
NR1D1P20393 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NR1D1P20393 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NR1D1P20393 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NR1D1P20393 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NR1D1P20393 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NR1D1P20393 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NR1D1P20393 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NR1D1P20393 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NR1D1P20393 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NR1D1P20393 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NR1D1P20393 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NR1D1P20393 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NR1D1P20393 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NR1D1P20393 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NR1D1P20393 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NR1D1P20393 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NR1D1P20393 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NR1D1P20393 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NR1D1P20393 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NR1D1P20393 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NR1D1P20393 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NR1D1P20393 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NR1D1P20393 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
NR1D1P20393 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
NR1D1P20393 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
NR1D1P20393 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NR1D1P20393 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NR1D1P20393 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NR1D1P20393 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NR1D1P20393 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NR1D1P20393 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NR1D1P20393 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NR1D1P20393 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NR1D1P20393 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NR1D1P20393 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NR1D1P20393 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NR1D1P20393 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NR1D1P20393 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NR1D1P20393 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NR1D1P20393 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NR1D1P20393 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NR1D1P20393 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NR1D1P20393 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NR1D1P20393 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NR1D1P20393 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
NR1D1P20393 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NR1D1P20393 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NR1D1P20393 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NR1D1P20393 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NR1D1P20393 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NR1D1P20393 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NR1D1P20393 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NR1D1P20393 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NR1D1P20393 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NR1D1P20393 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NR1D1P20393 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NR1D1P20393 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NR1D1P20393 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NR1D1P20393 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NR1D1P20393 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms