Protein–RNA interactions for Protein: P19012

KRT15, Keratin, type I cytoskeletal 15, humanhuman

Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT15P19012 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KRT15P19012 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
KRT15P19012 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
KRT15P19012 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
KRT15P19012 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
KRT15P19012 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KRT15P19012 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KRT15P19012 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KRT15P19012 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KRT15P19012 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KRT15P19012 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KRT15P19012 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KRT15P19012 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KRT15P19012 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KRT15P19012 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KRT15P19012 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KRT15P19012 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KRT15P19012 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KRT15P19012 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KRT15P19012 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KRT15P19012 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KRT15P19012 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
KRT15P19012 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KRT15P19012 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KRT15P19012 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KRT15P19012 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KRT15P19012 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KRT15P19012 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KRT15P19012 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KRT15P19012 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KRT15P19012 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KRT15P19012 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KRT15P19012 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KRT15P19012 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KRT15P19012 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KRT15P19012 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KRT15P19012 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KRT15P19012 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KRT15P19012 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KRT15P19012 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
KRT15P19012 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KRT15P19012 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KRT15P19012 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KRT15P19012 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
KRT15P19012 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KRT15P19012 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KRT15P19012 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KRT15P19012 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KRT15P19012 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
KRT15P19012 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
KRT15P19012 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
KRT15P19012 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
KRT15P19012 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
KRT15P19012 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
KRT15P19012 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
KRT15P19012 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
KRT15P19012 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
KRT15P19012 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
KRT15P19012 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
KRT15P19012 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
KRT15P19012 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
KRT15P19012 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
KRT15P19012 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
KRT15P19012 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
KRT15P19012 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
KRT15P19012 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
KRT15P19012 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KRT15P19012 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
KRT15P19012 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KRT15P19012 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KRT15P19012 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KRT15P19012 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KRT15P19012 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KRT15P19012 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
KRT15P19012 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KRT15P19012 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC21.32■■□□□ 1
KRT15P19012 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KRT15P19012 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KRT15P19012 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
KRT15P19012 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KRT15P19012 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KRT15P19012 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
KRT15P19012 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
KRT15P19012 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KRT15P19012 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KRT15P19012 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KRT15P19012 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KRT15P19012 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KRT15P19012 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
KRT15P19012 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KRT15P19012 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KRT15P19012 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KRT15P19012 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KRT15P19012 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
KRT15P19012 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KRT15P19012 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
KRT15P19012 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
KRT15P19012 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KRT15P19012 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
KRT15P19012 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms