Protein–RNA interactions for Protein: P12980

LYL1, Protein lyl-1, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYL1P12980 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LYL1P12980 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LYL1P12980 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LYL1P12980 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LYL1P12980 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
LYL1P12980 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
LYL1P12980 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LYL1P12980 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LYL1P12980 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LYL1P12980 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
LYL1P12980 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LYL1P12980 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LYL1P12980 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LYL1P12980 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LYL1P12980 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LYL1P12980 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LYL1P12980 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LYL1P12980 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LYL1P12980 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LYL1P12980 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LYL1P12980 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LYL1P12980 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LYL1P12980 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LYL1P12980 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LYL1P12980 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LYL1P12980 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LYL1P12980 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LYL1P12980 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LYL1P12980 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LYL1P12980 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LYL1P12980 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LYL1P12980 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LYL1P12980 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LYL1P12980 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LYL1P12980 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LYL1P12980 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LYL1P12980 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LYL1P12980 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LYL1P12980 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LYL1P12980 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LYL1P12980 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
LYL1P12980 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LYL1P12980 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LYL1P12980 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LYL1P12980 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LYL1P12980 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LYL1P12980 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LYL1P12980 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LYL1P12980 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LYL1P12980 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LYL1P12980 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LYL1P12980 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LYL1P12980 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LYL1P12980 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LYL1P12980 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LYL1P12980 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LYL1P12980 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LYL1P12980 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LYL1P12980 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LYL1P12980 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
LYL1P12980 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LYL1P12980 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LYL1P12980 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LYL1P12980 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
LYL1P12980 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LYL1P12980 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LYL1P12980 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LYL1P12980 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LYL1P12980 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LYL1P12980 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LYL1P12980 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LYL1P12980 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LYL1P12980 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LYL1P12980 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LYL1P12980 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LYL1P12980 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
LYL1P12980 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LYL1P12980 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LYL1P12980 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LYL1P12980 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LYL1P12980 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LYL1P12980 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LYL1P12980 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LYL1P12980 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LYL1P12980 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LYL1P12980 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LYL1P12980 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LYL1P12980 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LYL1P12980 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LYL1P12980 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LYL1P12980 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LYL1P12980 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LYL1P12980 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LYL1P12980 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LYL1P12980 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LYL1P12980 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
LYL1P12980 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
LYL1P12980 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
LYL1P12980 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
LYL1P12980 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms