Protein–RNA interactions for Protein: P0DP09

IGKV1-13, Immunoglobulin kappa variable 1-13, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGKV1-13P0DP09 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
IGKV1-13P0DP09 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
IGKV1-13P0DP09 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
IGKV1-13P0DP09 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
IGKV1-13P0DP09 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
IGKV1-13P0DP09 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
IGKV1-13P0DP09 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
IGKV1-13P0DP09 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
IGKV1-13P0DP09 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
IGKV1-13P0DP09 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
IGKV1-13P0DP09 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
IGKV1-13P0DP09 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
IGKV1-13P0DP09 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
IGKV1-13P0DP09 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
IGKV1-13P0DP09 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
IGKV1-13P0DP09 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
IGKV1-13P0DP09 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
IGKV1-13P0DP09 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
IGKV1-13P0DP09 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
IGKV1-13P0DP09 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
IGKV1-13P0DP09 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
IGKV1-13P0DP09 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
IGKV1-13P0DP09 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
IGKV1-13P0DP09 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
IGKV1-13P0DP09 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
IGKV1-13P0DP09 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
IGKV1-13P0DP09 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
IGKV1-13P0DP09 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
IGKV1-13P0DP09 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
IGKV1-13P0DP09 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
IGKV1-13P0DP09 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
IGKV1-13P0DP09 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
IGKV1-13P0DP09 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
IGKV1-13P0DP09 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
IGKV1-13P0DP09 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
IGKV1-13P0DP09 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
IGKV1-13P0DP09 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
IGKV1-13P0DP09 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
IGKV1-13P0DP09 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
IGKV1-13P0DP09 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
IGKV1-13P0DP09 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
IGKV1-13P0DP09 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
IGKV1-13P0DP09 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
IGKV1-13P0DP09 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
IGKV1-13P0DP09 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
IGKV1-13P0DP09 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
IGKV1-13P0DP09 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
IGKV1-13P0DP09 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
IGKV1-13P0DP09 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
IGKV1-13P0DP09 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
IGKV1-13P0DP09 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
IGKV1-13P0DP09 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
IGKV1-13P0DP09 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
IGKV1-13P0DP09 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
IGKV1-13P0DP09 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
IGKV1-13P0DP09 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
IGKV1-13P0DP09 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
IGKV1-13P0DP09 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
IGKV1-13P0DP09 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
IGKV1-13P0DP09 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
IGKV1-13P0DP09 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
IGKV1-13P0DP09 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
IGKV1-13P0DP09 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
IGKV1-13P0DP09 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
IGKV1-13P0DP09 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
IGKV1-13P0DP09 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
IGKV1-13P0DP09 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
IGKV1-13P0DP09 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
IGKV1-13P0DP09 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
IGKV1-13P0DP09 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
IGKV1-13P0DP09 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
IGKV1-13P0DP09 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
IGKV1-13P0DP09 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
IGKV1-13P0DP09 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
IGKV1-13P0DP09 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
IGKV1-13P0DP09 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
IGKV1-13P0DP09 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
IGKV1-13P0DP09 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
IGKV1-13P0DP09 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
IGKV1-13P0DP09 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
IGKV1-13P0DP09 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
IGKV1-13P0DP09 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
IGKV1-13P0DP09 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
IGKV1-13P0DP09 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
IGKV1-13P0DP09 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
IGKV1-13P0DP09 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
IGKV1-13P0DP09 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
IGKV1-13P0DP09 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
IGKV1-13P0DP09 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
IGKV1-13P0DP09 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
IGKV1-13P0DP09 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
IGKV1-13P0DP09 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
IGKV1-13P0DP09 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
IGKV1-13P0DP09 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
IGKV1-13P0DP09 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
IGKV1-13P0DP09 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
IGKV1-13P0DP09 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
IGKV1-13P0DP09 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
IGKV1-13P0DP09 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
IGKV1-13P0DP09 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms