Protein–RNA interactions for Protein: P0C2S0

CTXN2, Cortexin-2, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN2P0C2S0 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CTXN2P0C2S0 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CTXN2P0C2S0 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CTXN2P0C2S0 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CTXN2P0C2S0 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CTXN2P0C2S0 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CTXN2P0C2S0 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CTXN2P0C2S0 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CTXN2P0C2S0 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CTXN2P0C2S0 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CTXN2P0C2S0 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CTXN2P0C2S0 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CTXN2P0C2S0 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CTXN2P0C2S0 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CTXN2P0C2S0 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CTXN2P0C2S0 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CTXN2P0C2S0 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CTXN2P0C2S0 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CTXN2P0C2S0 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CTXN2P0C2S0 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CTXN2P0C2S0 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CTXN2P0C2S0 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CTXN2P0C2S0 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CTXN2P0C2S0 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CTXN2P0C2S0 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CTXN2P0C2S0 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CTXN2P0C2S0 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CTXN2P0C2S0 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CTXN2P0C2S0 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CTXN2P0C2S0 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CTXN2P0C2S0 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CTXN2P0C2S0 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CTXN2P0C2S0 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CTXN2P0C2S0 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CTXN2P0C2S0 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CTXN2P0C2S0 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CTXN2P0C2S0 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CTXN2P0C2S0 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CTXN2P0C2S0 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CTXN2P0C2S0 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CTXN2P0C2S0 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CTXN2P0C2S0 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CTXN2P0C2S0 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CTXN2P0C2S0 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CTXN2P0C2S0 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CTXN2P0C2S0 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CTXN2P0C2S0 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CTXN2P0C2S0 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CTXN2P0C2S0 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CTXN2P0C2S0 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CTXN2P0C2S0 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CTXN2P0C2S0 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CTXN2P0C2S0 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CTXN2P0C2S0 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CTXN2P0C2S0 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CTXN2P0C2S0 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CTXN2P0C2S0 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CTXN2P0C2S0 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CTXN2P0C2S0 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CTXN2P0C2S0 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CTXN2P0C2S0 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CTXN2P0C2S0 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CTXN2P0C2S0 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CTXN2P0C2S0 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CTXN2P0C2S0 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CTXN2P0C2S0 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CTXN2P0C2S0 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CTXN2P0C2S0 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CTXN2P0C2S0 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CTXN2P0C2S0 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CTXN2P0C2S0 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CTXN2P0C2S0 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CTXN2P0C2S0 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CTXN2P0C2S0 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CTXN2P0C2S0 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CTXN2P0C2S0 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CTXN2P0C2S0 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CTXN2P0C2S0 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CTXN2P0C2S0 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CTXN2P0C2S0 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CTXN2P0C2S0 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CTXN2P0C2S0 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CTXN2P0C2S0 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CTXN2P0C2S0 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CTXN2P0C2S0 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CTXN2P0C2S0 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CTXN2P0C2S0 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CTXN2P0C2S0 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CTXN2P0C2S0 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CTXN2P0C2S0 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CTXN2P0C2S0 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CTXN2P0C2S0 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CTXN2P0C2S0 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CTXN2P0C2S0 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CTXN2P0C2S0 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CTXN2P0C2S0 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CTXN2P0C2S0 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
CTXN2P0C2S0 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CTXN2P0C2S0 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CTXN2P0C2S0 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms