Protein–RNA interactions for Protein: P08729

KRT7, Keratin, type II cytoskeletal 7, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT7P08729 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KRT7P08729 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KRT7P08729 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KRT7P08729 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KRT7P08729 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KRT7P08729 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KRT7P08729 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KRT7P08729 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KRT7P08729 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KRT7P08729 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KRT7P08729 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KRT7P08729 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KRT7P08729 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KRT7P08729 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
KRT7P08729 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KRT7P08729 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KRT7P08729 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KRT7P08729 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KRT7P08729 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KRT7P08729 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KRT7P08729 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KRT7P08729 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KRT7P08729 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
KRT7P08729 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KRT7P08729 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KRT7P08729 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KRT7P08729 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KRT7P08729 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KRT7P08729 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
KRT7P08729 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KRT7P08729 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KRT7P08729 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KRT7P08729 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KRT7P08729 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KRT7P08729 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KRT7P08729 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KRT7P08729 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KRT7P08729 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KRT7P08729 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KRT7P08729 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KRT7P08729 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KRT7P08729 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KRT7P08729 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KRT7P08729 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KRT7P08729 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KRT7P08729 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KRT7P08729 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KRT7P08729 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KRT7P08729 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KRT7P08729 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
KRT7P08729 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
KRT7P08729 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
KRT7P08729 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KRT7P08729 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KRT7P08729 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KRT7P08729 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KRT7P08729 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KRT7P08729 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KRT7P08729 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KRT7P08729 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
KRT7P08729 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KRT7P08729 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KRT7P08729 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KRT7P08729 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KRT7P08729 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KRT7P08729 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KRT7P08729 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
KRT7P08729 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KRT7P08729 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KRT7P08729 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
KRT7P08729 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
KRT7P08729 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
KRT7P08729 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22■■□□□ 1.11
KRT7P08729 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
KRT7P08729 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KRT7P08729 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KRT7P08729 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KRT7P08729 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KRT7P08729 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KRT7P08729 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KRT7P08729 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KRT7P08729 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KRT7P08729 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KRT7P08729 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KRT7P08729 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KRT7P08729 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KRT7P08729 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KRT7P08729 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KRT7P08729 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KRT7P08729 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KRT7P08729 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KRT7P08729 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KRT7P08729 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KRT7P08729 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KRT7P08729 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KRT7P08729 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KRT7P08729 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KRT7P08729 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KRT7P08729 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KRT7P08729 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms