Protein–RNA interactions for Protein: P07199

CENPB, Major centromere autoantigen B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPBP07199 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CENPBP07199 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CENPBP07199 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CENPBP07199 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CENPBP07199 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CENPBP07199 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CENPBP07199 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CENPBP07199 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CENPBP07199 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CENPBP07199 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CENPBP07199 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CENPBP07199 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CENPBP07199 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CENPBP07199 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CENPBP07199 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CENPBP07199 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.24
CENPBP07199 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
CENPBP07199 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
CENPBP07199 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.24
CENPBP07199 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.24
CENPBP07199 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
CENPBP07199 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CENPBP07199 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CENPBP07199 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CENPBP07199 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CENPBP07199 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CENPBP07199 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CENPBP07199 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CENPBP07199 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CENPBP07199 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CENPBP07199 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CENPBP07199 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CENPBP07199 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CENPBP07199 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC29■■■□□ 2.23
CENPBP07199 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC29■■■□□ 2.23
CENPBP07199 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CENPBP07199 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CENPBP07199 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
CENPBP07199 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CENPBP07199 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CENPBP07199 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CENPBP07199 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CENPBP07199 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CENPBP07199 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CENPBP07199 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CENPBP07199 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CENPBP07199 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CENPBP07199 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CENPBP07199 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CENPBP07199 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CENPBP07199 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CENPBP07199 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CENPBP07199 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CENPBP07199 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
CENPBP07199 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CENPBP07199 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CENPBP07199 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CENPBP07199 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CENPBP07199 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CENPBP07199 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CENPBP07199 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CENPBP07199 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CENPBP07199 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CENPBP07199 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CENPBP07199 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CENPBP07199 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CENPBP07199 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CENPBP07199 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CENPBP07199 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CENPBP07199 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CENPBP07199 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CENPBP07199 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CENPBP07199 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CENPBP07199 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CENPBP07199 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CENPBP07199 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CENPBP07199 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CENPBP07199 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CENPBP07199 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CENPBP07199 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CENPBP07199 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CENPBP07199 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CENPBP07199 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CENPBP07199 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CENPBP07199 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CENPBP07199 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CENPBP07199 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CENPBP07199 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
CENPBP07199 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
CENPBP07199 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
CENPBP07199 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
CENPBP07199 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
CENPBP07199 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
CENPBP07199 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
CENPBP07199 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
CENPBP07199 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
CENPBP07199 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
CENPBP07199 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
CENPBP07199 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
CENPBP07199 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.5 ms