Protein–RNA interactions for Protein: P05937

CALB1, Calbindin, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALB1P05937 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CALB1P05937 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CALB1P05937 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CALB1P05937 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CALB1P05937 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CALB1P05937 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CALB1P05937 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CALB1P05937 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CALB1P05937 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CALB1P05937 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CALB1P05937 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CALB1P05937 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CALB1P05937 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CALB1P05937 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CALB1P05937 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CALB1P05937 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CALB1P05937 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CALB1P05937 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CALB1P05937 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CALB1P05937 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CALB1P05937 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CALB1P05937 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CALB1P05937 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CALB1P05937 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CALB1P05937 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CALB1P05937 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CALB1P05937 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CALB1P05937 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CALB1P05937 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CALB1P05937 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CALB1P05937 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CALB1P05937 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CALB1P05937 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CALB1P05937 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CALB1P05937 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CALB1P05937 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CALB1P05937 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CALB1P05937 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CALB1P05937 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CALB1P05937 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CALB1P05937 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CALB1P05937 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CALB1P05937 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CALB1P05937 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CALB1P05937 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CALB1P05937 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CALB1P05937 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CALB1P05937 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CALB1P05937 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CALB1P05937 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CALB1P05937 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CALB1P05937 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CALB1P05937 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CALB1P05937 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CALB1P05937 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CALB1P05937 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CALB1P05937 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CALB1P05937 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CALB1P05937 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CALB1P05937 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CALB1P05937 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CALB1P05937 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CALB1P05937 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CALB1P05937 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CALB1P05937 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CALB1P05937 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CALB1P05937 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CALB1P05937 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CALB1P05937 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CALB1P05937 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CALB1P05937 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CALB1P05937 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CALB1P05937 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CALB1P05937 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CALB1P05937 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CALB1P05937 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CALB1P05937 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CALB1P05937 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CALB1P05937 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CALB1P05937 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CALB1P05937 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CALB1P05937 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
CALB1P05937 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
CALB1P05937 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CALB1P05937 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CALB1P05937 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CALB1P05937 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CALB1P05937 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CALB1P05937 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CALB1P05937 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CALB1P05937 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CALB1P05937 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CALB1P05937 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CALB1P05937 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CALB1P05937 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CALB1P05937 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CALB1P05937 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CALB1P05937 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CALB1P05937 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CALB1P05937 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms