Protein–RNA interactions for Protein: P01599

IGKV1-17, Immunoglobulin kappa variable 1-17, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGKV1-17P01599 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
IGKV1-17P01599 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
IGKV1-17P01599 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
IGKV1-17P01599 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
IGKV1-17P01599 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
IGKV1-17P01599 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
IGKV1-17P01599 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
IGKV1-17P01599 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
IGKV1-17P01599 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
IGKV1-17P01599 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
IGKV1-17P01599 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
IGKV1-17P01599 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
IGKV1-17P01599 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
IGKV1-17P01599 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
IGKV1-17P01599 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
IGKV1-17P01599 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
IGKV1-17P01599 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
IGKV1-17P01599 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
IGKV1-17P01599 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
IGKV1-17P01599 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
IGKV1-17P01599 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
IGKV1-17P01599 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
IGKV1-17P01599 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
IGKV1-17P01599 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
IGKV1-17P01599 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
IGKV1-17P01599 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
IGKV1-17P01599 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
IGKV1-17P01599 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
IGKV1-17P01599 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
IGKV1-17P01599 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
IGKV1-17P01599 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
IGKV1-17P01599 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
IGKV1-17P01599 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
IGKV1-17P01599 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
IGKV1-17P01599 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
IGKV1-17P01599 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
IGKV1-17P01599 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
IGKV1-17P01599 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
IGKV1-17P01599 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IGKV1-17P01599 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IGKV1-17P01599 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IGKV1-17P01599 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IGKV1-17P01599 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IGKV1-17P01599 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IGKV1-17P01599 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IGKV1-17P01599 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IGKV1-17P01599 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IGKV1-17P01599 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
IGKV1-17P01599 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IGKV1-17P01599 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IGKV1-17P01599 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IGKV1-17P01599 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IGKV1-17P01599 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IGKV1-17P01599 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IGKV1-17P01599 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IGKV1-17P01599 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IGKV1-17P01599 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
IGKV1-17P01599 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
IGKV1-17P01599 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IGKV1-17P01599 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IGKV1-17P01599 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IGKV1-17P01599 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IGKV1-17P01599 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IGKV1-17P01599 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IGKV1-17P01599 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
IGKV1-17P01599 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IGKV1-17P01599 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IGKV1-17P01599 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IGKV1-17P01599 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IGKV1-17P01599 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IGKV1-17P01599 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IGKV1-17P01599 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IGKV1-17P01599 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
IGKV1-17P01599 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IGKV1-17P01599 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IGKV1-17P01599 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IGKV1-17P01599 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IGKV1-17P01599 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IGKV1-17P01599 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IGKV1-17P01599 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IGKV1-17P01599 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IGKV1-17P01599 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IGKV1-17P01599 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IGKV1-17P01599 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IGKV1-17P01599 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IGKV1-17P01599 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IGKV1-17P01599 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IGKV1-17P01599 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
IGKV1-17P01599 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IGKV1-17P01599 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IGKV1-17P01599 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
IGKV1-17P01599 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
IGKV1-17P01599 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IGKV1-17P01599 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IGKV1-17P01599 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IGKV1-17P01599 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IGKV1-17P01599 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
IGKV1-17P01599 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
IGKV1-17P01599 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IGKV1-17P01599 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms