Protein–RNA interactions for Protein: P00519

ABL1, Tyrosine-protein kinase ABL1, humanhuman

Predictions only

Length 1,130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABL1P00519 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ABL1P00519 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ABL1P00519 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ABL1P00519 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ABL1P00519 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ABL1P00519 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ABL1P00519 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ABL1P00519 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ABL1P00519 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ABL1P00519 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ABL1P00519 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ABL1P00519 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ABL1P00519 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ABL1P00519 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ABL1P00519 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ABL1P00519 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ABL1P00519 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ABL1P00519 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ABL1P00519 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ABL1P00519 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ABL1P00519 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
ABL1P00519 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
ABL1P00519 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ABL1P00519 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ABL1P00519 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ABL1P00519 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ABL1P00519 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ABL1P00519 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ABL1P00519 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ABL1P00519 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ABL1P00519 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
ABL1P00519 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
ABL1P00519 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ABL1P00519 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ABL1P00519 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ABL1P00519 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ABL1P00519 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ABL1P00519 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ABL1P00519 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ABL1P00519 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ABL1P00519 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ABL1P00519 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ABL1P00519 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ABL1P00519 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ABL1P00519 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ABL1P00519 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ABL1P00519 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ABL1P00519 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ABL1P00519 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
ABL1P00519 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ABL1P00519 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ABL1P00519 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ABL1P00519 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ABL1P00519 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ABL1P00519 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ABL1P00519 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ABL1P00519 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ABL1P00519 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ABL1P00519 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ABL1P00519 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ABL1P00519 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ABL1P00519 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ABL1P00519 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ABL1P00519 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
ABL1P00519 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ABL1P00519 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
ABL1P00519 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ABL1P00519 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ABL1P00519 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
ABL1P00519 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ABL1P00519 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ABL1P00519 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ABL1P00519 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ABL1P00519 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ABL1P00519 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ABL1P00519 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ABL1P00519 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ABL1P00519 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ABL1P00519 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ABL1P00519 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ABL1P00519 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ABL1P00519 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ABL1P00519 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ABL1P00519 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ABL1P00519 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ABL1P00519 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ABL1P00519 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ABL1P00519 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ABL1P00519 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ABL1P00519 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ABL1P00519 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ABL1P00519 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ABL1P00519 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ABL1P00519 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ABL1P00519 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ABL1P00519 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ABL1P00519 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ABL1P00519 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ABL1P00519 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ABL1P00519 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms