Protein–RNA interactions for Protein: O95104

SCAF4, Splicing factor, arginine/serine-rich 15, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAF4O95104 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SCAF4O95104 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SCAF4O95104 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SCAF4O95104 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SCAF4O95104 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SCAF4O95104 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SCAF4O95104 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SCAF4O95104 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SCAF4O95104 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SCAF4O95104 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SCAF4O95104 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SCAF4O95104 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SCAF4O95104 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SCAF4O95104 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
SCAF4O95104 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
SCAF4O95104 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SCAF4O95104 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SCAF4O95104 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SCAF4O95104 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SCAF4O95104 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SCAF4O95104 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SCAF4O95104 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SCAF4O95104 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SCAF4O95104 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SCAF4O95104 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SCAF4O95104 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SCAF4O95104 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SCAF4O95104 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SCAF4O95104 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SCAF4O95104 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SCAF4O95104 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SCAF4O95104 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SCAF4O95104 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SCAF4O95104 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SCAF4O95104 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SCAF4O95104 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SCAF4O95104 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SCAF4O95104 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SCAF4O95104 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SCAF4O95104 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SCAF4O95104 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SCAF4O95104 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SCAF4O95104 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SCAF4O95104 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SCAF4O95104 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SCAF4O95104 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SCAF4O95104 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SCAF4O95104 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SCAF4O95104 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SCAF4O95104 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SCAF4O95104 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SCAF4O95104 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SCAF4O95104 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SCAF4O95104 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SCAF4O95104 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SCAF4O95104 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SCAF4O95104 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SCAF4O95104 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SCAF4O95104 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SCAF4O95104 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SCAF4O95104 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SCAF4O95104 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SCAF4O95104 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SCAF4O95104 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SCAF4O95104 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SCAF4O95104 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SCAF4O95104 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SCAF4O95104 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SCAF4O95104 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SCAF4O95104 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SCAF4O95104 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SCAF4O95104 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SCAF4O95104 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SCAF4O95104 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SCAF4O95104 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SCAF4O95104 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SCAF4O95104 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SCAF4O95104 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SCAF4O95104 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SCAF4O95104 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SCAF4O95104 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SCAF4O95104 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SCAF4O95104 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SCAF4O95104 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SCAF4O95104 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SCAF4O95104 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SCAF4O95104 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SCAF4O95104 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SCAF4O95104 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SCAF4O95104 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SCAF4O95104 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SCAF4O95104 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SCAF4O95104 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SCAF4O95104 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SCAF4O95104 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SCAF4O95104 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SCAF4O95104 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SCAF4O95104 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SCAF4O95104 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SCAF4O95104 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms