Protein–RNA interactions for Protein: O75665

OFD1, Oral-facial-digital syndrome 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,012 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OFD1O75665 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
OFD1O75665 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
OFD1O75665 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
OFD1O75665 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
OFD1O75665 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
OFD1O75665 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
OFD1O75665 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
OFD1O75665 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
OFD1O75665 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
OFD1O75665 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
OFD1O75665 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
OFD1O75665 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
OFD1O75665 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
OFD1O75665 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
OFD1O75665 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
OFD1O75665 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
OFD1O75665 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
OFD1O75665 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
OFD1O75665 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
OFD1O75665 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
OFD1O75665 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
OFD1O75665 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
OFD1O75665 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
OFD1O75665 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
OFD1O75665 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
OFD1O75665 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
OFD1O75665 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
OFD1O75665 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
OFD1O75665 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
OFD1O75665 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
OFD1O75665 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
OFD1O75665 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
OFD1O75665 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
OFD1O75665 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
OFD1O75665 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
OFD1O75665 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
OFD1O75665 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
OFD1O75665 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
OFD1O75665 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
OFD1O75665 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
OFD1O75665 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
OFD1O75665 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
OFD1O75665 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
OFD1O75665 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
OFD1O75665 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
OFD1O75665 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
OFD1O75665 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
OFD1O75665 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
OFD1O75665 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
OFD1O75665 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
OFD1O75665 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
OFD1O75665 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
OFD1O75665 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
OFD1O75665 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
OFD1O75665 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
OFD1O75665 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
OFD1O75665 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
OFD1O75665 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
OFD1O75665 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
OFD1O75665 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
OFD1O75665 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
OFD1O75665 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
OFD1O75665 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
OFD1O75665 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
OFD1O75665 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
OFD1O75665 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
OFD1O75665 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
OFD1O75665 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
OFD1O75665 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
OFD1O75665 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
OFD1O75665 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
OFD1O75665 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
OFD1O75665 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
OFD1O75665 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
OFD1O75665 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
OFD1O75665 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
OFD1O75665 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
OFD1O75665 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
OFD1O75665 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
OFD1O75665 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
OFD1O75665 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
OFD1O75665 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
OFD1O75665 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
OFD1O75665 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
OFD1O75665 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
OFD1O75665 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
OFD1O75665 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
OFD1O75665 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
OFD1O75665 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
OFD1O75665 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
OFD1O75665 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
OFD1O75665 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
OFD1O75665 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
OFD1O75665 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
OFD1O75665 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
OFD1O75665 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
OFD1O75665 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
OFD1O75665 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
OFD1O75665 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
OFD1O75665 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms