Protein–RNA interactions for Protein: O75323

NIPSNAP2, Protein NipSnap homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP2O75323 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NIPSNAP2O75323 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NIPSNAP2O75323 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NIPSNAP2O75323 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NIPSNAP2O75323 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NIPSNAP2O75323 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NIPSNAP2O75323 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NIPSNAP2O75323 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
NIPSNAP2O75323 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
NIPSNAP2O75323 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
NIPSNAP2O75323 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
NIPSNAP2O75323 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
NIPSNAP2O75323 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
NIPSNAP2O75323 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
NIPSNAP2O75323 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
NIPSNAP2O75323 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
NIPSNAP2O75323 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
NIPSNAP2O75323 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
NIPSNAP2O75323 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NIPSNAP2O75323 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NIPSNAP2O75323 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NIPSNAP2O75323 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NIPSNAP2O75323 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NIPSNAP2O75323 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NIPSNAP2O75323 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NIPSNAP2O75323 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NIPSNAP2O75323 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NIPSNAP2O75323 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NIPSNAP2O75323 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NIPSNAP2O75323 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NIPSNAP2O75323 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NIPSNAP2O75323 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
NIPSNAP2O75323 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NIPSNAP2O75323 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NIPSNAP2O75323 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NIPSNAP2O75323 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NIPSNAP2O75323 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NIPSNAP2O75323 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NIPSNAP2O75323 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NIPSNAP2O75323 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
NIPSNAP2O75323 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC20.87■□□□□ 0.93
NIPSNAP2O75323 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
NIPSNAP2O75323 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NIPSNAP2O75323 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NIPSNAP2O75323 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NIPSNAP2O75323 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NIPSNAP2O75323 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NIPSNAP2O75323 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NIPSNAP2O75323 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
NIPSNAP2O75323 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
NIPSNAP2O75323 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
NIPSNAP2O75323 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
NIPSNAP2O75323 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC20.86■□□□□ 0.93
NIPSNAP2O75323 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
NIPSNAP2O75323 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NIPSNAP2O75323 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NIPSNAP2O75323 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NIPSNAP2O75323 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NIPSNAP2O75323 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
NIPSNAP2O75323 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
NIPSNAP2O75323 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NIPSNAP2O75323 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
NIPSNAP2O75323 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
NIPSNAP2O75323 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NIPSNAP2O75323 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
NIPSNAP2O75323 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NIPSNAP2O75323 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
NIPSNAP2O75323 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
NIPSNAP2O75323 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NIPSNAP2O75323 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
NIPSNAP2O75323 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
NIPSNAP2O75323 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NIPSNAP2O75323 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NIPSNAP2O75323 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NIPSNAP2O75323 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NIPSNAP2O75323 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NIPSNAP2O75323 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
NIPSNAP2O75323 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
NIPSNAP2O75323 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
NIPSNAP2O75323 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
NIPSNAP2O75323 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NIPSNAP2O75323 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NIPSNAP2O75323 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NIPSNAP2O75323 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC20.84■□□□□ 0.93
NIPSNAP2O75323 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
NIPSNAP2O75323 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
NIPSNAP2O75323 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NIPSNAP2O75323 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NIPSNAP2O75323 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NIPSNAP2O75323 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NIPSNAP2O75323 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NIPSNAP2O75323 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NIPSNAP2O75323 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
NIPSNAP2O75323 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
NIPSNAP2O75323 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NIPSNAP2O75323 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NIPSNAP2O75323 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
NIPSNAP2O75323 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
NIPSNAP2O75323 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC20.84■□□□□ 0.93
NIPSNAP2O75323 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms