Protein–RNA interactions for Protein: O60488

ACSL4, Long-chain-fatty-acid--CoA ligase 4, humanhuman

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Length 711 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSL4O60488 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
ACSL4O60488 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
ACSL4O60488 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
ACSL4O60488 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ACSL4O60488 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ACSL4O60488 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ACSL4O60488 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ACSL4O60488 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ACSL4O60488 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ACSL4O60488 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ACSL4O60488 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ACSL4O60488 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ACSL4O60488 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
ACSL4O60488 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ACSL4O60488 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
ACSL4O60488 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ACSL4O60488 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ACSL4O60488 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ACSL4O60488 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ACSL4O60488 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ACSL4O60488 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ACSL4O60488 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ACSL4O60488 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ACSL4O60488 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ACSL4O60488 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ACSL4O60488 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ACSL4O60488 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ACSL4O60488 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ACSL4O60488 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ACSL4O60488 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ACSL4O60488 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ACSL4O60488 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ACSL4O60488 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ACSL4O60488 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
ACSL4O60488 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ACSL4O60488 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ACSL4O60488 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
ACSL4O60488 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ACSL4O60488 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ACSL4O60488 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ACSL4O60488 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ACSL4O60488 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ACSL4O60488 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ACSL4O60488 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ACSL4O60488 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ACSL4O60488 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ACSL4O60488 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ACSL4O60488 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ACSL4O60488 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ACSL4O60488 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ACSL4O60488 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ACSL4O60488 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ACSL4O60488 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
ACSL4O60488 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ACSL4O60488 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ACSL4O60488 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ACSL4O60488 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ACSL4O60488 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ACSL4O60488 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ACSL4O60488 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
ACSL4O60488 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ACSL4O60488 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ACSL4O60488 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ACSL4O60488 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ACSL4O60488 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ACSL4O60488 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ACSL4O60488 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ACSL4O60488 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ACSL4O60488 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ACSL4O60488 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
ACSL4O60488 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
ACSL4O60488 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ACSL4O60488 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ACSL4O60488 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ACSL4O60488 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ACSL4O60488 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ACSL4O60488 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ACSL4O60488 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ACSL4O60488 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ACSL4O60488 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ACSL4O60488 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ACSL4O60488 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ACSL4O60488 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ACSL4O60488 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ACSL4O60488 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ACSL4O60488 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ACSL4O60488 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
ACSL4O60488 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ACSL4O60488 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ACSL4O60488 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ACSL4O60488 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ACSL4O60488 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ACSL4O60488 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ACSL4O60488 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ACSL4O60488 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ACSL4O60488 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ACSL4O60488 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ACSL4O60488 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ACSL4O60488 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ACSL4O60488 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
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