Protein–RNA interactions for Protein: O43583

DENR, Density-regulated protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENRO43583 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
DENRO43583 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
DENRO43583 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
DENRO43583 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
DENRO43583 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
DENRO43583 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
DENRO43583 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
DENRO43583 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
DENRO43583 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
DENRO43583 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
DENRO43583 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
DENRO43583 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
DENRO43583 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
DENRO43583 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
DENRO43583 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
DENRO43583 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
DENRO43583 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
DENRO43583 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
DENRO43583 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
DENRO43583 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
DENRO43583 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
DENRO43583 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
DENRO43583 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
DENRO43583 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
DENRO43583 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
DENRO43583 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
DENRO43583 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
DENRO43583 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
DENRO43583 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
DENRO43583 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
DENRO43583 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
DENRO43583 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
DENRO43583 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
DENRO43583 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
DENRO43583 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
DENRO43583 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
DENRO43583 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
DENRO43583 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
DENRO43583 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
DENRO43583 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
DENRO43583 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
DENRO43583 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
DENRO43583 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
DENRO43583 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
DENRO43583 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
DENRO43583 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
DENRO43583 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
DENRO43583 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
DENRO43583 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
DENRO43583 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
DENRO43583 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
DENRO43583 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
DENRO43583 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
DENRO43583 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
DENRO43583 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
DENRO43583 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
DENRO43583 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
DENRO43583 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
DENRO43583 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
DENRO43583 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
DENRO43583 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
DENRO43583 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
DENRO43583 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
DENRO43583 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
DENRO43583 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
DENRO43583 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
DENRO43583 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
DENRO43583 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
DENRO43583 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
DENRO43583 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
DENRO43583 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
DENRO43583 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
DENRO43583 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
DENRO43583 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
DENRO43583 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
DENRO43583 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
DENRO43583 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
DENRO43583 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
DENRO43583 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
DENRO43583 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
DENRO43583 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
DENRO43583 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
DENRO43583 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
DENRO43583 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
DENRO43583 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
DENRO43583 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
DENRO43583 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
DENRO43583 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
DENRO43583 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
DENRO43583 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
DENRO43583 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
DENRO43583 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
DENRO43583 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
DENRO43583 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
DENRO43583 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
DENRO43583 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
DENRO43583 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
DENRO43583 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
DENRO43583 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
DENRO43583 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms